Baza danych modyfikacji RNA
Te bazy danych modyfikacji RNA są kompilacją baz danych i portali internetowych oraz serwerów używanych do modyfikacji RNA. Modyfikacja RNA występuje we wszystkich żywych organizmach i jest jedną z najbardziej zachowanych ewolucyjnie właściwości RNA. We wszystkich żywych organizmach scharakteryzowano ponad 100 różnych typów modyfikacji RNA. Może wpływać na aktywność, lokalizację oraz stabilność RNA i jest powiązana z rakiem i chorobami u ludzi.
Bazy danych modyfikacji RNA
Nazwa | Opis | typ | Połączyć | Bibliografia |
---|---|---|---|---|
RMBase | RMBase jest przeznaczony do dekodowania krajobrazu modyfikacji RNA zidentyfikowanych na podstawie danych sekwencjonowania o dużej przepustowości (Pseudo-seq, Ψ-seq, CeU-seq, Aza-IP, MeRIP-seq, m6A-seq, miCLIP, m6A-CLIP, RiboMeth- nast . ) Wykazano tysiące modyfikacji RNA zlokalizowanych w mRNA, regulatorowych ncRNA (np. lncRNA, miRNA), docelowych miejscach miRNA, miejscach wiążących białka wiążące RNA (RBP) i SNP związanych z chorobą . | Baza danych | strona internetowa | |
MODOMIKA | MODOMICS to baza danych modyfikacji RNA, która dostarcza wyczerpujących informacji dotyczących budowy chemicznej zmodyfikowanych rybonukleozydów, ich szlaków biosyntezy , enzymów modyfikujących RNA oraz lokalizacji zmodyfikowanych reszt w sekwencjach RNA. | Baza danych | strona internetowa | |
RNAMDB | RNAMDB służył jako centralny punkt informacji dotyczących naturalnie występujących modyfikacji RNA | Baza danych | strona internetowa | |
. |
Kategorie: