Białko grupy o wysokiej ruchliwości HMG14 i HMG17
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HMG14 i HMG17 | |||||||||
| Symbol | HMG14_17 | ||||||||
| Pfam | PF01101 | ||||||||
| InterPro | IPR000079 | ||||||||
| PROZYTA | PDOC00307 | ||||||||
| |||||||||
Grupa białek o wysokiej ruchliwości HMG14 i HMG17, znana również jako domena wiążąca nukleosomy, jest rodziną białek spokrewnionych ewolucyjnie .
Białka grupy o wysokiej ruchliwości (HMG) stanowią rodzinę niehistonowych składników chromatyny o stosunkowo niskiej masie cząsteczkowej . HMG14 i HMG17 są wysoce podobnymi białkami o około 100 resztach aminokwasowych; sekwencja kurzego HMG14 jest prawie tak samo podobna do kurzego HMG17, jak do ssaczych polipeptydów HMG14. Białka wiążą się z wewnętrzną stroną nukleosomalnego DNA, zmieniając oddziaływanie między DNA a oktamerem histonowym . Uważa się, że mogą one być zaangażowane w proces, który nadaje określone konformacje chromatyny regionom podlegającym transkrypcji w genomie.
Sygnatura SMART opisuje domenę wiążącą nukleosom, która ułatwia wiązanie białek z nukleosomami w chromatynie. Domena występuje najczęściej w białkach z grupy wysokiej ruchliwości (HMG), HMG14 i HMG17, ale występuje również w innych białkach wiążących się z nukleosomami, np. NBP-45. NBP-45 jest białkiem wiążącym nukleosomy, po raz pierwszy zidentyfikowanym u myszy, które jest spokrewnione z HMG14 i HMG17. NBP-45 wiąże się specyficznie z cząsteczkami rdzenia nukleosomu i może działać jako aktywator transkrypcji. Odkrycia te doprowadziły do sugestii, że ta domena, wspólna dla NBP-45, HMG14 i HMG17, jest odpowiedzialna za wiązanie białek z nukleosomami w chromatynie.
Przykłady
Białka ludzkie zawierające tę domenę obejmują: