BioKreatywny

BioCreAtIvE (Krytyczna ocena metod eksploracji tekstu w biologii molekularnej ) polega na ogólnospołecznym wysiłku oceny rozwoju ekstrakcji informacji i eksploracji tekstu w domenie biologicznej.

Poprzedziło go wyzwanie Knowledge Discovery and Data Mining (KDD) Challenge Cup w celu wykrywania wzmianek o genach.

Wyzwania społeczności

Pierwsza edycja

W pierwszym wyzwaniu BioCreAtIvE postawiono trzy główne zadania: zadanie ekstrakcji jednostki, zadanie normalizacji nazwy genu oraz zadanie funkcjonalnej adnotacji produktów genów. Zestawy danych opracowane w ramach tego konkursu służą jako zestaw szkoleniowy i testowy Złotego Standardu do oceny i szkolenia narzędzi Bio-NER i narzędzi do ekstrakcji adnotacji.

Druga edycja

Drugie wyzwanie BioCreAtIvE (2006-2007) również obejmowało 3 zadania: wykrywanie wzmianek o genach, ekstrakcję unikalnych identyfikatorów genów oraz ekstrakcję informacji związanych z fizycznymi interakcjami białko-białko. Liczył się udział 44 drużyn z 13 krajów.

Trzecia edycja

Trzecia edycja BioCreative obejmowała po raz pierwszy InterActive Task (IAT), zaprojektowane do oceny praktycznej użyteczności narzędzi eksploracji tekstu w rzeczywistych zadaniach biokuracji .

Piąta edycja

BioCreative V miał 5 różnych ścieżek, w tym interaktywne zadanie (IAT) dotyczące użyteczności systemów eksploracji tekstu oraz ścieżkę wykorzystującą format BioC do zbierania informacji dla BioGRID .

Zobacz też

Biokuracja

Linki zewnętrzne