porównanie , które zawiera nazwę tego klubu piłkarskiego „Tener más moral que el Alcoyano” („Mieć większe morale niż Alcoyano”) . Wyrażenie prawdopodobnie pochodzi z lat pięćdziesiątych XX wieku, kiedy Alcoyano przegrywał mecz u siebie 0-13, ale nigdy się nie poddawał, wciąż starając się zdobyć bramkę na koniec meczu. Jednak niektórzy historycy kwestionują to, a pochodzenie jest nieco niejasne. Oficjalnym hymnem klubu jest „La moralny del Alcoyano” (Alcoyano moralny), muzyka Miguel Peidró i Jaime Lloret oraz słowa Armando Santacreu. Został skomponowany w 1979 roku z okazji 50-lecia klubu. W 2004 roku, zbiegając się z 75-leciem klubu, unowocześniono muzykę, a hymn wykonał wokalista José Zamora.
Miasto Alcoy miało bardzo ważny klub, Boxing Club Deportivo Alcoyano. W 1927 roku jego sekcja piłki nożnej wygrała wiele meczów z głównymi klubami, co doprowadziło do powstania klubu piłkarskiego. Club Deportivo Alcoyano ujrzał światło dzienne w 1928 roku, po fuzji dwóch klubów w mieście, Levante i Racing. Jednak dopiero cztery lata później dołączył do Królewskiej Hiszpańskiej Federacji Piłki Nożnej .
W 1942 roku klub po raz pierwszy dotarł do Segunda División , przechodząc na przemian z tego poziomu do najwyższej ligi w kolejnych latach. Ich debiut w tym ostatnim odbył się po porażce 2: 3 u siebie z Realem Murcia , ostatecznie spadając z ligi jako drugi od końca. W tym sezonie klub zdobył tylko 8 punktów i stracił 28 bramek w 14 rozegranych meczach, najgorszy wynik wśród 8 zespołów. Po raz pierwszy w historii Alcoyano osiągnął La Liga , pierwszą ligę hiszpańską, w 1945 roku, wygrywając Segunda División.
W latach 1947–48 Alcoyano po raz pierwszy w swojej historii utrzymał status pierwszej ligi, zajmując nawet wyższe miejsce niż Real Madryt . Ten sezon był najlepszy w historii Alcoyano – klub zajął 10. miejsce w La Liga. Następne czterdzieści lat spędził jednak głównie w trzeciej i czwartej lidze , z bardzo krótkimi okresami na poziomie drugim. W sezonie 1953-54 Alcoyano po raz pierwszy w swojej historii spadł do Tercera División . W sezonie 1954-55 klub osiągnął pierwsze miejsce w grupie 10 Tercera División, ale nie udało mu się awansować z powrotem do Segunda División B.
W czerwcu 2011 roku, 42 lata później, Alcoyano w końcu wrócił do drugiej ligi, zajmując trzecie miejsce w sezonie zasadniczym i pokonując Real Madryt Castilla , SD Eibar i CD Lugo w barażach o awans . Jednak klub spędził tylko jeden sezon w drugiej lidze i spadł z powrotem do Segunda División B. W dniu 1 sierpnia 2014 roku klub zakończył proces przekształcenia w „Public Limited Sports Company” (Sociedad Anónima Deportiva).
W sezonie 2018-19 klub Alcoyano zajął 16. miejsce w Segunda División B, grupa 3, blisko miejsca spadkowego.
20 stycznia 2021 roku Alcoyano przeszedł do historii, eliminując hiszpańskich gigantów i aktualnych mistrzów La Liga Real Madryt z Copa del Rey 2020–21 , pokonując ich u siebie 2: 1.