CNF-Sr3
CNF-Sr3 , znany również jako konorfamid-Sr3 , jest toksyną pochodzącą z przewodu jadowego Conus spurius . CNF-Sr3 jest inhibitorem kanału Shakera , podtypu kanałów potasowych bramkowanych napięciem .
Etymologia i źródło
CNF-Sr3 (konorfamid-Sr3) znajduje się w przewodzie jadowym robakowatego Conus spurius , ślimaka morskiego z Zatoki Meksykańskiej.
Chemia
Struktura
CNF-Sr3 składa się z 15 reszt aminokwasowych i nie zawiera reszt cysteiny. Masa monoizotopowa białka wynosi 1726,77 daltonów. Sekwencja CNF-Sr3 to ATSGPMGWLPVFYRF.
Rodzina
CNF-Sr3 należy do rodziny konorfamidów razem z CNF-Sr1 5, CNF-Sr2 1 i CNF-Vc1. CNF-Sr1, CNF-Sr2 i CNF-Sr3 znajdują się w przewodzie jadowym Conus spurius . CNF-Vc1 znajduje się w jadzie Conus victoriae . Konorfamidy mają podobieństwo sekwencji z FMRFamidem i innymi peptydami pokrewnymi FMRFa (FaRP). Wszystkie konorfamidy są konotoksynami ubogimi w dwusiarczki .
Homologia
CNF-Sr3 ma 73,3% podobieństwa sekwencji z CNF-Sr1 i 31,0% podobieństwa sekwencji z CNF-Sr2. CNF-Sr3 ma trzy dodatkowe reszty aminokwasowe na końcu aminowym i Leu zamiast Val w pozycji 8 w porównaniu z CNF-Sr12.
Sekwencje aminokwasowe konorfamidów przedstawiono poniżej: [1]
| Konorfamid-Sr1 | Gly-Pro-Met-Gly-Trp-Val-Pro-Val-Phe-Tyr-Arg-Phe |
| Konorfamid-Sr2 | Gly-Pro-Met-Glu-Asp-Pro-Leu-Glu-Ile-Ile-Arg-Ile |
| Konorfamid-Sr3 | Ala-Thr-Ser-Gly-Pro-Met-Gly-Trp-Leu-Pro-Val-Phe-Tyr-Arg-Phe |
| Konorfamid-Vc1 | His-Ser-Gly-Phe-Leu-Leu-Ala-Trp-Ser-Gly-Pro-Arg-Asn-Arg-Phe-Val-Arg-Phe |
Cel
CNF-Sr3 blokuje kanały K+ wytrząsarki z umiarkowanym powinowactwem, z Kd = 2,7 ± 0,35 μM (średnia ± SEM). Kanał Shakera jest podtypem kanałów potasowych bramkowanych napięciem . Hamowanie kanałów Shakera przez CNF-Sr3 jest odwracalne. Ta toksyna nie blokuje Shab , Shaw , Shal i Eag .