Cykl kwantyfikacji/kwalifikacji
Cykl kwantyfikacji/kwalifikacji ( Cq ) jest parametrem stosowanym w technikach reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym , wskazującym numer cyklu, w którym krzywa amplifikacji PCR spełnia z góry określone kryterium matematyczne. ACq można zastosować do ilościowego oznaczenia sekwencji docelowej lub do określenia, czy sekwencja docelowa jest obecna, czy nie .
Różne termocyklery stosują dwa kryteria do określenia Cq : cykl progowy ( Ct ) to liczba cykli wymagana do przekroczenia przez sygnał fluorescencyjny określonej wartości progowej . Zazwyczaj wartość progowa jest ustalana powyżej linii bazowej, około 10-krotność odchylenia standardowego szumu linii bazowej, aby uniknąć przypadkowego wpływu na Ct . Jednak próg nie powinien być ustawiony znacznie wyżej, aby uniknąć zmniejszonej odtwarzalności z powodu niekontrolowanych czynników.
Punkt przecięcia (Cp) i punkt startu (TOP) to wartość cyklu maksymalnej drugiej pochodnej krzywej amplifikacji.