DODATKI
Deweloperzy | Nicka Pattersona i Davida Reicha |
---|---|
Pierwsze wydanie | 2012 |
Wersja stabilna | 2.0 |
Magazyn | |
Napisane w | R |
System operacyjny | Windowsa, Linuksa itp. |
Typ | Genetyka populacji |
Strona internetowa |
ADMIXTOOLS (lub AdmixTools ) to pakiet oprogramowania R , który jest używany głównie do analizy domieszek w genetyce populacji . Pierwotna wersja została pierwotnie opracowana przez Nicka Pattersona i współpracowników w 2012 roku. Druga ponownie wdrożona wersja, ADMIXTOOLS 2, która ma poprawiony interfejs typu „wskaż i kliknij” oraz poprawioną szybkość, została opracowana wspólnie przez Nicka Pattersona i Davida Reicha .
qpWykres
qpGraph to oprogramowanie będące częścią pakietu oprogramowania ADMIXTOOLS opracowanego przez Pattersona i in. (2012). qpGraph buduje wykresy, które modelują domieszkę genetyczną w relacjach między populacjami. Oszacowuje prawdopodobieństwo topologii sieci na podstawie ustalonej liczby zdarzeń domieszek, w oparciu o obserwowane statystyki f .
Inne narzędzia
Powiązane narzędzia statystyczne w pakiecie oprogramowania ADMIXTOOLS obejmują qpAdm , qpDstat i qpWave . qpDstat i qpWave testują, czy populacje tworzą klady , podczas gdy qpAdm szacuje proporcje przodków.
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- ADMIXTOOLS 2 – wnioskowanie o historii demograficznej z danych genetycznych
- AdmixTools w GitHub
- Pakiet oprogramowania qpGraph w Bioconductor 3.8. doi : 10.18129/B9.bioc.qpgraph
- admixr – pakiet R do powtarzalnych analiz przy użyciu ADMIXTOOLS