Domena EGF wiążąca wapń
| domeny EGF wiążącej | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 wapń ludzkiego białka związanego z mbl 19 (map19)
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | EGF_CA | ||||||||
| Pfam | PF07645 | ||||||||
| Klan Pfam | CL0001 | ||||||||
| InterPro | IPR013091 | ||||||||
| CDD | cd00054 | ||||||||
| |||||||||
W biologii molekularnej domena EGF wiążąca wapń jest domeną podobną do EGF , składającą się z około czterdziestu reszt aminokwasowych występujących w naskórkowym czynniku wzrostu (EGF). Ta domena jest obecna w wielu białkach związanych z błoną i pozakomórkowych , głównie zwierzęcych . Wiele z tych białek wymaga wapnia do swoich funkcji biologicznych, a miejsce wiązania wapnia znaleziono na N-końcu niektórych domen podobnych do EGF . Wiązanie wapnia może mieć kluczowe znaczenie dla wielu interakcji białko-białko .
W przypadku ludzkiego czynnika krzepnięcia IX wykazano, że ligandy wapnia tworzą pięciokątną bipiramidę. Pierwsza, trzecia i czwarta konserwatywna reszta naładowana ujemnie lub polarna to ligandy łańcucha bocznego . Ten ostatni jest prawdopodobnie hydroksylowany . Uważa się, że konserwatywna aromatyczna , jak również druga konserwatywna reszta ujemna, bierze udział w stabilizacji miejsca wiązania wapnia.
domenach podobnych do EGF, które nie wiążą wapnia , istnieje sześć konserwatywnych cystein , a struktura obu typów jest bardzo podobna, ponieważ wiązanie wapnia indukuje tylko ściśle lokalne zmiany strukturalne .