Domena runt

Uruchom
identyfikatory domen
Symbol Karzeł
Pfam PF00853
InterPro IPR013524
SCOP2 1cmo / ZAKRES / SUPFAM
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury
WPB O:48-182 C:60-182 D:60-182

C:60-182 A:48-182 A:48-182 E:50-182 A:61-175 C:50-182

B:51-181 A:52-178

Domena Runta jest konserwowaną ewolucyjnie domeną białkową .

AML1 / RUNX1 jest rearanżowany przez translokację t(8;21) w ostrej białaczce szpikowej . Gen jest bardzo podobny do runt genu segmentacji Drosophila melanogaster i do genu podjednostki alfa mysiego czynnika transkrypcyjnego PEBP2. Region wspólnego podobieństwa, znany jako domena Runta, jest odpowiedzialny za wiązanie DNA i interakcje białko-białko.

Oprócz wysoce konserwatywnej domeny Runt, produkt genu AML-1 niesie domniemane miejsce wiązania ATP (GRRSGRGKS) i ma C-końcowy region bogaty w reszty proliny i seryny. Białko (znane jako białko ostrej białaczki szpikowej 1, onkogen AML-1, czynnik wiążący rdzeń (CBF), podjednostka alfa-B itp.) wiąże się z miejscem rdzenia, 5'-pygpyggt-3', wielu wzmacniacze i promotory.

Białko jest heterodimerem składającym się z podjednostek alfa i beta. Podjednostka alfa wiąże DNA jako monomer i wydaje się odgrywać rolę w rozwoju prawidłowej hematopoezy. CBF jest białkiem jądrowym wyrażanym w wielu typach tkanek, z wyjątkiem mózgu i serca; Stwierdzono, że najwyższe poziomy występują w grasicy, szpiku kostnym i krwi obwodowej.

Domena ta występuje w kierunku N-końca białek w tym wpisie.

Przykłady

Ludzkie geny kodujące białka zawierające tę domenę obejmują:

Zobacz też

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR013524