Domena runt
Uruchom | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identyfikatory domen | |||||||||||
Symbol | Karzeł | ||||||||||
Pfam | PF00853 | ||||||||||
InterPro | IPR013524 | ||||||||||
SCOP2 | 1cmo / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||||
|
Domena Runta jest konserwowaną ewolucyjnie domeną białkową .
AML1 / RUNX1 jest rearanżowany przez translokację t(8;21) w ostrej białaczce szpikowej . Gen jest bardzo podobny do runt genu segmentacji Drosophila melanogaster i do genu podjednostki alfa mysiego czynnika transkrypcyjnego PEBP2. Region wspólnego podobieństwa, znany jako domena Runta, jest odpowiedzialny za wiązanie DNA i interakcje białko-białko.
Oprócz wysoce konserwatywnej domeny Runt, produkt genu AML-1 niesie domniemane miejsce wiązania ATP (GRRSGRGKS) i ma C-końcowy region bogaty w reszty proliny i seryny. Białko (znane jako białko ostrej białaczki szpikowej 1, onkogen AML-1, czynnik wiążący rdzeń (CBF), podjednostka alfa-B itp.) wiąże się z miejscem rdzenia, 5'-pygpyggt-3', wielu wzmacniacze i promotory.
Białko jest heterodimerem składającym się z podjednostek alfa i beta. Podjednostka alfa wiąże DNA jako monomer i wydaje się odgrywać rolę w rozwoju prawidłowej hematopoezy. CBF jest białkiem jądrowym wyrażanym w wielu typach tkanek, z wyjątkiem mózgu i serca; Stwierdzono, że najwyższe poziomy występują w grasicy, szpiku kostnym i krwi obwodowej.
Domena ta występuje w kierunku N-końca białek w tym wpisie.
Przykłady
Ludzkie geny kodujące białka zawierające tę domenę obejmują:
Zobacz też
- Gen reguł parowania - dla genu runt u Drosophila melanogaster