Rok 2008 rozpoczął się z hukiem od porażki 52-0 z Indiana State. Dla długoletnich fanów była to zapłata za żenującą porażkę z ISU w 2001 roku. Mimo mocnego startu Eastern przegrał 4 punkty tuż po otwarciu iw żadnym z nich nie był blisko. Potem wywołali zamieszanie drogowe w Bowling Green, który wcześniej w tym roku pokonał członka BCS Pittsburgh. Ale potem ponieśli dwie bliskie straty, po trzy w West Point z armią i siedem u siebie z Akron.
Po przegranej z Temple 22 listopada 2008 roku Eastern Michigan zwolnił trenera Jeffa Genyka, ale pozwolił mu trenować ostatni mecz sezonu Eagle przeciwko rywalowi z Central Michigan. Wiele meczów przegranych 7 punktami lub mniej było jednym z powodów zwolnienia Genyka. Eastern wygrał jednak ten mecz 56-52. Dwa rekordy krajowe zostały ustanowione przeciwko CMU, ponieważ QB Andy Schmitt miał 58 ukończeń, a Tyler Jones wyrównał rekord, łapiąc 23 podania. Po zwycięstwie Eastern Michigan nad Central Michigan, wszystkie trzy szkoły podzieliły serię, a Eastern zachował Michigan MAC Trophy po remisie. Schmitt ukończył 58/80 na 516 jardów (rekord szkoły), rzucił 5 niszczycieli czołgów i pobiegł po jeszcze jednego. Większość z tych rekordów została zresetowana zaledwie tydzień wcześniej przeciwko Temple. W tej grze Schmitt zakończył 50/76 na 485 jardów, ale Eastern miał przewagę trzech punktów. Jego 76 podań w meczu bez przechwytu ustanowiło rekord NCAA. Został przechwycony tylko raz przeciwko Central z 80 podaniami.
Powrót Schmitta jako piątego roku seniora w 2009 roku był dla fanów punktem optymizmu. W tych dwóch meczach miał 108/156 na 1001 jardów i 1 przechwycenie. Być może sezon 2009 byłby zupełnie inny (zamiast 0-12), gdyby Schmitt nie doznał kontuzji kolana, która zakończyła karierę na początku tego sezonu.
