Dzup

Identyfikatory
białek supresorowych uszkodzeń
Organizm	Ramazzottius varieornatus
Symbol	Dzup
UniProt	P0DOW4
Szukaj Struktury Model szwajcarski Domeny InterPro

Dsup ( supresor skurczu uszkodzeń ) jest białkiem związanym z DNA , unikalnym dla niesporczaków , które hamuje występowanie pęknięć DNA pod wpływem promieniowania. Kiedy ludzkie komórki HEK293 zostały zmodyfikowane za pomocą białek Dsup, wykazywały one około 40% większą tolerancję na promieniowanie rentgenowskie.

Niesporczaki mogą wytrzymać 1000 razy więcej promieniowania niż inne zwierzęta, mediana śmiertelnych dawek 5000 Gy (promieni gamma) i 6200 Gy (ciężkich jonów) u nawodnionych zwierząt (od 5 do 10 Gy może być śmiertelne dla człowieka). Jedynym wyjaśnieniem tej zdolności znalezionym we wcześniejszych eksperymentach było to, że ich obniżony stan wodny zapewnia mniej reagentów dla promieniowania jonizującego . Jednak późniejsze badania wykazały, że niesporczaki, gdy są nawodnione, nadal pozostają wysoce odporne na krótkofalowe promieniowanie UV w porównaniu z innymi zwierzętami, a jednym z czynników jest ich zdolność do skutecznej naprawy uszkodzeń ich DNA wynikających z tej ekspozycji. Przełomowe badanie nad białkiem Dsup wykazało, że może ono wiązać nukleosomy w komórce i chronić DNA.

Białko Dsup zostało przetestowane na innych komórkach zwierzęcych. Wykorzystując hodowlę ludzkich komórek wykazujących ekspresję białka Dsup, stwierdzono, że po ekspozycji na promieniowanie rentgenowskie komórki miały mniej pęknięć DNA niż komórki kontrolne.

Funkcja i struktura

Dsup z Ramazzottius varieornatus jest używany głównie do badań, ponieważ jest jednym z najbardziej odpornych na stres gatunków. Ortologiczne wersje Dsup znajdują się również w Hypsibius exemplaris (OQV24709,). Dsup nie wykazuje dużej struktury drugorzędowej, z wyjątkiem helisy w środku. C-końcowa połowa zawiera NLS, a ta bogata w Ala/Gly połowa jest wystarczająca do wiązania DNA. Jest prawdopodobnie w większości nieuporządkowany, ale ma dużo ładunku dodatniego.

Wiadomo, że Dsup wiąże się z wolnym DNA, ale mocniej wiąże się z nukleosomami , typową upakowaną formą DNA w komórkach eukariotycznych. Jego domena wiążąca nukleosom jest nieco podobna do tej w HMGN .

Symulacja dynamiki molekularnej Dsup w kompleksie z DNA pokazuje, że jest to białko wewnętrznie nieuporządkowane . Jego elastyczność i ładunek elektrostatyczny pomagają wiązać się z DNA i tworzyć agregaty.