Element destabilizujący pętlę pnia czynnika G-CSF
| Czynnik G-CSF element destabilizujący pętlę pnia (SLDE) | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji G-CSF_SLDE
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | G-CSF_SLDE |
| Rfam | RF00183 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis-reg |
| Domeny | Eukariota |
| WIĘC | SO: 0000233 |
| Struktury PDB | PDBe |
Element destabilizujący pętlę macierzystą czynnika G-CSF (SLDE) jest elementem RNA wydzielanym przez fibroblasty i komórki śródbłonka w odpowiedzi na mediatory stanu zapalnego, interleukinę-1 (IL-1) i czynnik martwicy nowotworu-alfa oraz przez aktywowane makrofagi . Synteza G-CSF jest regulowana zarówno transkrypcyjnie , jak i poprzez kontrolę stabilności mRNA . W komórkach niestymulowanych mRNA G-CSF jest niestabilne, ale stabilizuje się w odpowiedzi na IL-1 lub czynnik martwicy nowotworu alfa, a także w przypadku monocytów i makrofagów w odpowiedzi na lipopolisacharyd . Jest prawdopodobne, że obecność SLDE w mRNA G-CSF przyczynia się do specyficzności regulacji mRNA G-CSF i zwiększa szybkość skracania ogona poli( A) .
Elementy bogate w urydylan adenylanu (AURE) są obecne w innych mRNA cytokin, ale SLDE jest najważniejszym elementem stabilizującym mRNA G-CSF w odpowiedzi na IL-1 lub czynnik martwicy nowotworów alfa. Dodatkowo w IL-2 i IL-6 występują elementy destabilizujące podobne do SLDE . 3'-UTR mRNA G-CSF zawiera element destabilizujący, który jest niewrażliwy na jonofor wapnia , stąd SLDE reguluje mRNA G-CSF. AUDE nie działają w komórkach raka pęcherza 5637, ale SLDE tak. Dwa elementy destabilizujące, SLDE i AURE, zapewniają wiele mechanizmów regulujących ekspresję cytokin.
Neutrofile są najbardziej rozpowszechnionym rodzajem granulocytów i są odpowiedzialne za prowadzenie pierwszej odpowiedzi układu odpornościowego na najeźdźców. Czynnik stymulujący tworzenie kolonii granulocytów (G-CSF) jest glikoproteiną , która stymuluje proliferację komórek progenitorowych neutrofili i prowadzi do dojrzewania neutrofili. monocyty i makrofagi są komórkami, które wydzielają G-CSF, ale stwierdzono, że komórki śródbłonka , fibroblasty i komórki zrębowe szpiku kostnego również wydzielają glikoproteinę. Ekspresja glikoproteiny G-CSF jest złożona i podlega zarówno regulacji transkrypcyjnej, jak i potranskrypcyjnej. nieulegającym translacji regionie 3' (3'UTR) mRNA G-CSF obecne są dwa specyficzne typy elementów regulatorowych . Elementy te są określane jako elementy bogate w urydylan adenylanu (AURE) i element destabilizujący pętlę łodygi (SLDE). Wykazano, że są one elementami destabilizującymi mRNA G-CSF. Z drugiej strony stabilność mRNA jest regulowana przez kinazę białkową aktywowaną mitogenem p38 (MAPK) i wykazano, że ten enzym fosforylujący jest połączony z AURE w 3'UTR.
SB203580 specyficznie hamuje aktywność katalityczną p38 MAPK przez kompetycyjne wiązanie się z miejscem aktywnym, w którym ATP ma się wiązać i jest używany do badania roli p38 MAPK w komórkach. SB203580 amplifikował indukowany przez lipopolisacharyd wzrost poziomów mRNA G-CSF w makrofagach pochodzących ze szpiku kostnego myszy i ludzkich makrofagach THP-1. Wykazując, że rozpad mRNA G-CSF w obecności aktynomycyny D był wolniejszy w komórkach traktowanych SB203580. SB203580 zwiększał stabilność mRNA G-CSF. SLDE jest niezbędny do indukowanego przez SB203580 wzrostu stabilności mRNA.