Faza pucharowa Pucharu Narodów Afryki 2019 była drugą i ostatnią po fazie grupowej fazą rozgrywek. Rozpoczęło się 5 lipca 1/8 finału, a zakończyło 19 lipca 2019 roku finałem , który odbył się na Cairo International Stadium w Kairze . W sumie 16 drużyn (dwie najlepsze drużyny z każdej grupy oraz cztery najlepsze drużyny z trzecich miejsc) awansowało do fazy pucharowej, aby rywalizować w turnieju w stylu pojedynczej eliminacji .
W fazie pucharowej, z wyjątkiem barażu o trzecie miejsce, jeśli mecz był wyrównany na koniec 90 minut normalnego czasu gry, rozgrywana była dogrywka ( dwie kwarty po 15 minut każda). Jeśli po dogrywce nadal był remis, mecz decydował rzut karny w celu wyłonienia zwycięzcy. W barażach o trzecie miejsce, jeśli wyniki pozostaną wyrównane po 90 minutach, mecz zakończy się bezpośrednio rzutami karnymi, bez rozgrywania dogrywki.
CAF przedstawił następujący harmonogram 1/8 finału:
Mecz 37 : Zwycięzca grupy B przeciwko 3. grupie A/C/D
Mecz 38 : Drugie miejsce w grupie A przeciwko drugie miejsce w grupie C
Mecz 39 : Zwycięzca grupy A przeciwko trzeciej grupie C/D/E
Mecz 40 : Zwycięzca grupy C przeciwko 3. grupie A/B/F
Mecz 41 : Zwycięzca grupy D przeciwko 3. grupie B/E/F
Mecz 42 : Wicemistrz grupy B v. wicemistrz grupy F
Mecz 43 : Zwycięzca grupy E przeciwko drugiej grupie D
Mecz 44 : Zwycięzca grupy F przeciwko drugiej grupie E
Kombinacje meczów w 1/8 finału
Konkretne pojedynki z udziałem drużyn z trzecich miejsc zależały od tego, które cztery drużyny z trzecich miejsc zakwalifikowały się do 1/8 finału:
Kombinacja według czterech zakwalifikowanych drużyn
Zespoły, które zajmą trzecie miejsce, awansują z grup
1A kontra
1B vs
1C vs
1D vs
A
B
C
D
3C
3D
3A
3B
A
B
C
mi
3C
3A
3B
3E
A
B
C
F
3C
3A
3B
3F
A
B
D
mi
3D
3A
3B
3E
A
B
D
F
3D
3A
3B
3F
A
B
mi
F
3E
3A
3B
3F
A
C
D
mi
3C
3D
3A
3E
A
C
D
F
3C
3D
3A
3F
A
C
mi
F
3C
3A
3F
3E
A
D
mi
F
3D
3A
3F
3E
B
C
D
mi
3C
3D
3B
3E
B
C
D
F
3C
3D
3B
3F
B
C
mi
F
3E
3C
3B
3F
B
D
mi
F
3E
3D
3B
3F
C
D
mi
F
3C
3D
3F
3E
Wykwalifikowane zespoły
Dwie najlepsze drużyny z każdej z sześciu grup oraz cztery najlepsze drużyny z trzecich miejsc zakwalifikowały się do fazy pucharowej.