Główne białko płaszcza faga
| Płaszcz faga Gp8 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Pojedyncza podjednostka białka płaszcza
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | Phage_Coat_Gp8 | ||||||||
| Pfam | PF05371 | ||||||||
| Klan Pfam | CL0371 | ||||||||
| InterPro | IPR008020 | ||||||||
| SCOP2 | 1fdm / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 67 | ||||||||
| Białko OPM | 1jeśli | ||||||||
| |||||||||
W biologii molekularnej głównym białkiem otoczki faga jest białko alfa-helikalne , które tworzy wirusową otoczkę bakteriofagów nitkowatych . Te bakteriofagi to elastyczne pręciki o długości około jednego do dwóch mikrometrów i średnicy sześciu nm , ze spiralną powłoką podjednostek białkowych otaczających rdzeń DNA . Podjednostka złożona z około 50 reszt głównego białka otoczki jest w dużej mierze alfa-helisą , a oś alfa-helisy tworzy mały kąt z osią wirionu . Otoczkę białkową można podzielić na trzy części: zewnętrzną powierzchnię, zajętą przez N-końcowy region podjednostki i bogatą w reszty kwasowe, które nadają wirionowi niski punkt izoelektryczny ; wnętrze otoczki (w tym 19-resztowy odcinek niepolarnych łańcuchów bocznych), gdzie podjednostki białkowe oddziałują , głównie między sobą; i wewnętrzną powierzchnię (zajętą przez C-końcowy region podjednostki), bogatą w dodatnio naładowane reszty , które oddziałują z DNA .