Imitacja SWI

ISWI lub imitacja SWI to białko występujące w muszce owocowej . Jest to pierwsza podjednostka ATPazy , która została wyizolowana z rodziny remodelującej chromatynę ISWI . Białko to wykazuje wysoki poziom podobieństwa do SWI/SNF w domenie ATPazy. Poza domeną ATPazy ISWI traci podobieństwo do członka rodziny SWI/SNF, posiadając domenę SANT zamiast bromodomeny . Białko ISWI może wchodzić w interakcje z kilkoma białkami, dając trzy różne kompleksy przebudowy chromatyny u Drosophila melanogaster : NURF ( czynnik przebudowy nukleosomu ), CHRAC (kompleks przebudowy i składania chromatyny) i ACF (czynnik przebudowy i montażu chromatyny wykorzystujący ATP).

In vitro samo białko ISWI może składać nukleosomy na liniowym DNA i może przenosić nukleosomy na liniowym DNA od środka do końców. Wewnątrz kompleksu CHRAC, ISWI katalizuje reakcję odwrotną, przesuwając nukleosomy z kończyn do środka.

Generowanie pętli w dsDNA

Badanie pojedynczej cząsteczki przy użyciu mikroskopii sił atomowych (AFM) i ruchu cząstek na uwięzi (TPM) wykazało, że ISWI może wiązać nagi DNA pod nieobecność ATP , owijając DNA wokół białka. W obecności ATP białko generuje pętle DNA, jednocześnie generując ujemne superskręty w szablonie. Pierwszy rysunek w tym artykule pokazuje trzy obrazy AFM, z których pojedynczy DNA oddziałujący z ISWI został osadzony na powierzchniach miki. Na środku pojedynczy ISWI jest związany pod koniec szablonu dsDNA. Prawy obraz przedstawia dwie pętle DNA wygenerowane przez ISWI. Te pętle zawierają supercewki. Zamiast tego badanie TPM wykazało, że czas trwania pętli utworzonej przez ISWI był zależny od ATP.