Iwan Eryl
Ivan Erill | |
|---|---|
 Ivan Erill w 2019 roku.
| |
| Urodzić się | 1972 (50-51 lat) Hiszpania
|
| Alma Mater |
|
| Znany z | genomika porównawcza bakterii |
| Kariera naukowa | |
| Pola | |
| Instytucje |
|
| Praca dyplomowa | Szybka reakcja łańcuchowa polimerazy w chipach zgodnych z CMOS (2003) |
| Doradca doktorski |
|
| Strona internetowa | |
Ivan Erill jest hiszpańskim biologiem obliczeniowym znanym ze swoich badań w dziedzinie genomiki porównawczej i mikrobiologii molekularnej . Jego praca koncentruje się przede wszystkim na genomice porównawczej bakterii, poprzez rozwój metod obliczeniowych do analizy sieci regulacyjnych i ich ewolucji .
Edukacja i kariera
Ivan Erill uzyskał tytuł licencjata z informatyki w 1996 r. i doktorat z informatyki w 2003 r. na Uniwersytecie Autonomicznym w Barcelonie za pracę nad projektowaniem systemów mikroelektromechanicznych do analizy DNA w CSIC Microelectronics Institute w Barcelonie. W 2008 roku został adiunktem na Wydziale Nauk Biologicznych Uniwersytetu Maryland w hrabstwie Baltimore . W 2014 awansował na profesora nadzwyczajnego, a w 2022 na profesora zwyczajnego.
Badania
Ivan Erill rozpoczął swoją karierę naukową od pracy nad rozwojem systemów mikroelektromechanicznych do zastosowań biomedycznych. Jego prace obejmowały projektowanie urządzeń do PCR i elektroforezy DNA na CMOS w celu ułatwienia integracji obwodów kontrolnych i wykrywających na chipie oraz projektowanie mikroigieł czujnikowych do monitorowania niedokrwienia serca i przeszczepów narządów, co doprowadziło do pierwszego ciągłego monitorowania przeszczepów temperatura narządów podczas transportu.
Jego prace nad genomiką porównawczą drobnoustrojów koncentrowały się głównie na badaniu sieci regulacyjnych transkrypcji . Pracując nad odpowiedzią SOS jako siecią modelową, Erill opracował RCGScanner, a później CGB, aby przeanalizować ewolucję tego systemu transkrypcyjnego w wielu grupach bakterii, ujawniając, że ta odpowiedź na uszkodzenie DNA jest ewolucyjna w oparciu o syntezę translezji, a nie naprawę DNA, jak tradycyjnie zakładano. We współpracy z innymi grupami opisał wiele rozbieżnych motywów wiążących dla represora transkrypcji SOS i wykazano, że sieci SOS mogą być regulowane przez represory transkrypcyjne kodowane przez bakteriofagi.
Praca Erilla koncentrowała się również na ewolucyjnej dynamice czynników transkrypcyjnych i ich miejscach wiązania, wykorzystując symulacje ewolucyjne i analizy oparte na teorii informacji , a także analizy porównawcze motywów wiążących TF z wykorzystaniem bazy danych CollecTF opracowanej przez jego laboratorium . Zastosował również podejście genomiczne, aby wyjaśnić ewolucję genów oporności na antybiotyki i ich rozpowszechnianie, ujawniając, że geny oporności mogą poprzedzać rozwój związków przeciwdrobnoustrojowych oraz że antybiotyki mogą indukować rozprzestrzenianie się genów oporności poprzez indukowanie bocznego transferu genów, w którym pośredniczą integrony i inne ruchome elementy genetyczne.