Kapsyd Flawiwirusa szpilka do włosów CHP
| szpilka kapsydu flawiwirusa cHP | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji cHP
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | CHP |
| Rfam | RF00617 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis-reg |
| Domeny | Wirusy |
| WIĘC | SO: 0000233 |
| Struktury PDB | PDBe |
CHP kapsydu kapsydu cHP jest konserwowaną strukturą spinki do włosów RNA zidentyfikowaną w regionie kodującym kapsyd kilku genomów flawiwirusów . Te RNA o dodatniej nici są tłumaczone jako pojedynczy polipeptyd, a następnie cięte na białka składowe, z których pierwszym jest białko kapsydu. Szpilka cHP znajduje się w regionie kodującym kapsyd między dwoma kodonami startowymi AUG . Wykazano, że element cis cHP kieruje początek translacji z suboptymalnego pierwszego kodonu startowego. Zdolność cHP do bezpośredniej inicjacji z pierwszego kodonu start jest proporcjonalna do jego stabilności termodynamicznej, jest zależna od pozycji i niezależna od sekwencji. Wykazano, że zarówno AUG, jak i konserwatywny cHP są niezbędne do wydajnej replikacji wirusa w komórkach ludzkich i komarów.