Karen Koch (biolog roślin)

Karen Koch jest biologiem roślin na wydziale nauk ogrodniczych na University of Florida . Jest profesorem w programie Plant Molecular and Cellular Biology (PMCB), na Wydziale Nauk Ogrodniczych i w Instytucie Genetyki na University of Florida.

Zainteresowania badawcze

Laboratorium Kocha jest najbardziej znane z badań nad ekspresją genów reagujących na cukier i zdolnością tego procesu do zmiany formy i funkcji roślin. Dostępność cukru dostarcza kluczowych wskazówek dla dostosowania genów wpływających na alokację C i N w roślinach. Spośród wszystkich składników odżywczych i hormonów sacharoza pozostaje „życiową krwią” roślin. Cukier ten zajmuje naprawdę centralną pozycję w transporcie naczyniowym, rozkładzie węgla w roślinie i jako źródło sygnałów cukrowych dla reagujących genów.

Jej grupa koncentruje się zatem na genach, które wpływają na metabolizm sacharozy, jej udziale w sygnalizacji cukrowej i jej podziale na różne produkty końcowe. Szczególną uwagę zwraca się na kukurydzy , skład ściany komórkowej i mechanizmy przenoszenia cukru. Mutanty z nokautem pojedynczego genu są wykorzystywane do badania funkcji genów.

Obecny [ kiedy? ] projekty testują hipotezy dotyczące podziału węgla i ekspresji genów w rozwijających się jajnikach kukurydzy od zróżnicowania kwiatowego do zbioru ziarna, a także dotyczące udziału kluczowych genów w biosyntezie ściany komórkowej na strategicznych etapach rozwoju (np. wydłużanie włośników i łagiewki pyłkowej, fazy różnicowania ziarniaków i wzrostu siewek).

Badania i praca

  • Podejścia genetyczne i genomiczne do zrozumienia transportu na duże odległości i podziału węgla. NSF-PGRP. Brauna i in. (2011-2015). Różne podejścia obejmują testowanie mechanizmów funkcji łyka i podziału węgla w kukurydzy i rzodkiewniku.
  • Adaptacja metabolizmu jądra w celu zwiększenia plonów zbóż w niesprzyjających warunkach. NIFA. Hannah i in. (2011-2014). Głównym celem jest tolerancja na ciepło genów dla suchej masy jądra.
  • UniformMu: zasób transpozonów do mutagenezy w kukurydzy. NSF-PGRP. McCarty'ego i Kocha. (2007-2011; 2011-2013). Nokaut pojedynczego genu stanowi doskonały sposób testowania funkcji genów, a linie mutantów są obecnie dostępne dla ponad jednej trzeciej genów kukurydzy.

Lista publikacji

Oto lista publikacji z laboratorium Kocha.

Nagrody

Koch jest laureatem nagrody Charlesa Reida Barnesa w 2016 r. , najstarszej nagrody Amerykańskiego Towarzystwa Biologów Roślin (ASPB). Według ASPB „Karen celował w badaniach, szkoleniu studentów biologii roślin oraz w służbie Towarzystwu. Jej badania nad metabolizmem węglowodanów i sygnalizacją cukrową są znane na całym świecie, a jej szkolenie studentów biologii roślin jest legendarne”.

Jej praca nad metabolizmem węgla i wpływem cukrów na ekspresję genów była jedną z pięciu stypendystów przyjętych przez organizację ASPB w 2012 roku. Ramy „uczty i głodu” Kocha dotyczące regulacji ekspresji genów stanowią podstawę do zrozumienia reakcji organów roślinnych na sygnalizację cukrową w celu optymalizacji alokacji zasobów. Służyła grupie jako wybrany członek jej Komitetu Wykonawczego i jest pierwszym stypendystą ASPB z Florydy. Była w Plant Physiology od 1987 do 1993.