Skład pseudoK-tuple nukleotydów

Kompozycja pseudo-K-nukleotydów lub PseKNC została rozszerzona z kompozycji pseudoaminokwasów Chou (PseAAC). Zarówno PseAAC, jak i PseKNC mają deskryptor wektora, ale pierwszy reprezentuje sekwencje białek lub peptydów , podczas gdy drugi reprezentuje sekwencje DNA lub RNA .

Kuo-Chen Chou zaproponował PseAAC . Aby rozwiązać problem sekwencji DNA i RNA, zaproponowano kompozycję pseudo K-tuple nukleotydową , czyli PseKNC. Dla wygody społeczności naukowej w latach 2013 i 2014 opracowano ogólnodostępny serwer internetowy o nazwie PseKNC i pakiet open source o nazwie PseKNC-General , który umożliwiał konwersję wielkoskalowych zbiorów danych sekwencji na kompozycje pseudonukleotydowe z możliwością wyboru wielu kombinacji właściwości fizykochemicznych . PseKNC-General może generować kilka trybów kompozycji pseudonukleotydów, w tym konwencjonalne kompozycje k-tuple nukleotydów, współczynnik autokorelacji Moreau – Broto, współczynnik autokorelacji Morana, współczynnik autokorelacji Geary'ego, PseKNC typu I i PseKNC typu II.

Podobnie jak PseAAC w proteomice obliczeniowej i analizie proteomu , PseKNC jest również coraz częściej stosowany w genomice obliczeniowej i przeprowadzaniu różnych analiz genomu .