MAPA
Deweloperzy | Ariel Schwartz ( UC Berkeley ), Lior Pachter ( UC Berkeley ) |
---|---|
Wersja stabilna | 2.0 |
System operacyjny | UNIX , Linux , Mac |
Typ | Narzędzie bioinformatyczne |
Licencja | Otwarte źródło |
Strona internetowa | Pobieranie AMAP |
AMAP to program dopasowywania wielu sekwencji oparty na hybrydyzacji sekwencji. Podejście to polega na konstruowaniu wielu dopasowań po jednym dopasowaniu na raz, co pozwala na obejście wielu problemów związanych z progresywnym dopasowaniem. Parametry AMAP można wykorzystać do dostrojenia kompromisu między czułością a specyficznością.
Program może być używany przez serwer WWW AMAP lub jako samodzielny program, który można zainstalować z kodem źródłowym.
Wejście wyjście
Ten program akceptuje sekwencje w formacie FASTA .
Format wyjściowy obejmuje: format FASTA , Clustal .
Linki zewnętrzne
Kategoria: