MAPA

MAPA
Deweloperzy Ariel Schwartz ( UC Berkeley ), Lior Pachter ( UC Berkeley )
Wersja stabilna
2.0
System operacyjny UNIX , Linux , Mac
Typ Narzędzie bioinformatyczne
Licencja Otwarte źródło
Strona internetowa Pobieranie AMAP

AMAP to program dopasowywania wielu sekwencji oparty na hybrydyzacji sekwencji. Podejście to polega na konstruowaniu wielu dopasowań po jednym dopasowaniu na raz, co pozwala na obejście wielu problemów związanych z progresywnym dopasowaniem. Parametry AMAP można wykorzystać do dostrojenia kompromisu między czułością a specyficznością.

Program może być używany przez serwer WWW AMAP lub jako samodzielny program, który można zainstalować z kodem źródłowym.

Wejście wyjście

Ten program akceptuje sekwencje w formacie FASTA .

Format wyjściowy obejmuje: format FASTA , Clustal .

Linki zewnętrzne