Mapa Biosite'u
Biositemap to sposób, w jaki organizacja zajmująca się badaniami biomedycznymi może pokazać, w jaki sposób informacje biologiczne są rozpowszechniane w ich systemach i sieciach informatycznych . Informacje te mogą być udostępniane innym organizacjom i naukowcom.
Biositemap umożliwia przeglądarkom internetowym , robotom indeksującym i robotom łatwy dostęp i przetwarzanie informacji w celu wykorzystania ich w innych systemach, mediach i formatach obliczeniowych. Protokoły Biositemaps dostarczają wskazówek dla zbieraczy sieci Biositemap , umożliwiając im znajdowanie zasobów i treści w całym wzajemnym połączeniu systemu Biositemap. Oznacza to, że użytkownicy ludzie lub maszyny mogą uzyskać dostęp do wszelkich istotnych informacji na dowolny temat we wszystkich organizacjach w całym systemie Biositemap i przenieść je do własnych systemów w celu asymilacji lub analizy.
Struktura plików
Informacje są zwykle przechowywane w pliku biositemap.rdf lub biositemap.xml, który zawiera listy informacji o danych, oprogramowaniu, narzędziach, materiałach i usługach dostarczonych lub posiadanych przez tę organizację. Informacje są prezentowane w metapolach i mogą być tworzone online za pośrednictwem witryn takich jak edytor online biositemaps.
Informacje są mieszanką map witryn i kanałów RSS i są tworzone przy użyciu modelu informacyjnego (IM) i ontologii zasobów biomedycznych (BRO). IM jest odpowiedzialny za zdefiniowanie danych przechowywanych w metapolach, a BRO kontroluje terminologię danych przechowywanych w polu resource_type. BRO ma kluczowe znaczenie we wspomaganiu interaktywności zarówno innych organizacji, jak i stron trzecich w wyszukiwaniu i udoskonalaniu tych wyszukiwań.
Formaty danych
Protokół Biositemaps umożliwia naukowcom, inżynierom, ośrodkom i instytucjom zajmującym się modelowaniem, opracowywaniem narzędzi programowych i analizą danych biomedycznych i informatycznych nadawanie i rozpowszechnianie na całym świecie informacji o ich najnowszych zasobach biologii obliczeniowej (dane, narzędzia programowe i usługi sieciowe ) . Koncepcja biositemap opiera się na pomysłach z Efficient, Automated Web Resource Harvesting i przyjaznych robotom sieciowym serwerów i integruje funkcje map witryn i kanałów RSS w zdecentralizowany mechanizm dla biologów obliczeniowych i bioinformatyków do otwartego rozpowszechniania i pobierania metadanych o zasobach biomedycznych.
biositemap specyficzne dla miejsca, instytucji lub badacza są publikowane online w formacie RDF i są przeszukiwane, analizowane, monitorowane i interpretowane przez wyszukiwarki internetowe, aplikacje internetowe specyficzne dla biositemap i ontologii oraz inne aplikacje zainteresowane odkrywaniem zaktualizowanych lub nowych zasobów dla bioinformatyki i badań biomedycznych. Mechanizm biositemap oddziela dostawców zasobów biomedycznych (badaczy lub instytucji) od konsumentów treści zasobów (naukowców, klinicystów, media informacyjne, agencje finansujące, inicjatywy edukacyjne i badawcze).
Biositemap to plik RDF zawierający listę zasobów biomedycznych i bioinformatycznych dla określonej grupy badawczej lub konsorcjum. Pozwala twórcom zasobów biomedycznych opisywać funkcjonalność i użyteczność każdego z ich narzędzi programowych, baz danych lub usług internetowych.
Biositemaps uzupełniają i nie zastępują istniejących ram rozpowszechniania danych, narzędzi i usług. Korzystanie z biositemap nie gwarantuje, że zasoby zostaną uwzględnione w indeksach wyszukiwania ani nie wpływa na sposób, w jaki narzędzia są oceniane lub postrzegane przez społeczność. Protokół Biositemaps zapewni wskazówki, informacje i wytyczne dla wszystkich zbieraczy sieciowych Biositemap, które wskazują na istnienie i zawartość zasobów biomedycznych w różnych miejscach.
Model informacyjny Biositemap
Protokół Biositemap opiera się na rozszerzalnym modelu informacji, który obejmuje określone właściwości, które są powszechnie używane i niezbędne do charakteryzowania zasobów biomedycznych:
- Nazwa
- Opis
- Adres URL
- Etap rozwoju
- Organizacja
- Etykieta ontologii zasobów
- Słowa kluczowe
- Licencja
Aktualna dokumentacja modelu informacyjnego jest dostępna na stronie internetowej Biositemaps.