Marianne Frommer

Marianne Frommer jest australijską genetyczką. Urodziła się w Hongkongu i wykształciła na Uniwersytecie w Sydney – licencjat (z wyróżnieniem) w 1969 r. i doktorat w 1976 r. Najbardziej znana jest z opracowania protokołu do mapowania metylacji DNA za pomocą sekwencjonowania genomowego wodorosiarczynem .

Kariera

Na początku swojej kariery Frommer badała biologię molekularną „satelitarnego DNA” w ludzkim genomie. Ona i jej koleżanka Jane Prosser wykazały, że wszystkie klasyczne satelity były bogatymi w A+T prostymi, powtarzalnymi sekwencjami. Innym ważnym rezultatem była identyfikacja sekwencji Alu (SINE) jako części powtarzającej się jednostki w satelicie 1, pokazując w ten sposób, że SINE mogą być wysoce powtarzalnym składnikiem centromerowej heterochromatyny.

Następnie Frommer określił położenie chromosomów głównych powtórzeń prostych sekwencji, opracowując nową metodę znakowania nieradioaktywnego, opartą na włączeniu bromodeoksyurydyny do jednoniciowych sond. Metodę wykorzystano do bardzo precyzyjnej lokalizacji powtórzeń satelitów. Badania te doprowadziły do ​​obserwacji wzorców metylacji dinukleotydów CpG w zsekwencjonowanym powtarzalnym genomowym DNA.

W 1984 roku Frommer spędził urlop naukowy w laboratorium Adriana Birda i brał udział w charakteryzowaniu tak zwanych wysp HTF (HpaII Tiny Fragments) w genomach ssaków. Ona i jej doktorantka Margaret Gardiner-Garden byli w stanie zidentyfikować te komponenty genomowe na podstawie samej charakterystyki sekwencji DNA, bez wcześniejszej wiedzy o statusie metylacji, i nadali im nazwę „wyspy CpG”. Wykazali, że wyspy CpG są odrębną cechą genomów kręgowców i że wyspy CpG są związane z genami. Wykazali, że większość genów neuronalnych i neuroendokrynnych była związana z wyspami CpG i dlatego zaproponowali, że wyspy CpG ułatwiają regulowaną transkrypcję z prekursorów neuronów i rozwój tkanki nerwowej we wczesnym zarodku.

W 1998 Frommer zdał sobie sprawę, że powinno być możliwe amplifikowanie produktów reakcji deaminacji DNA i rozróżnienie cząsteczek metylowanych i niemetylowanych za pomocą sekwencjonowania dideoksy. Protokół Frommera dał wyraźny pozytywny wynik reszt metylocytozyny. Produkty PCR reakcji wodorosiarczynowych można sekwencjonować bezpośrednio, aby zmierzyć stopień metylacji w dowolnym miejscu CpG w populacji cząsteczek DNA. Szczególną siłą tej metody było to, że klonowanie i sekwencjonowanie produktów PCR dało wzorce metylacji lub „mapy” pojedynczych cząsteczek DNA.

Frommer i jej współpracownicy opracowali również potężny system modelowy do badania biologii molekularnej cech behawioralnych i procesów ewolucyjnych przy użyciu rodzimych australijskich muszek owocowych.

Nagrody

Frommer została wybrana na członka Australijskiej Akademii Nauk w 2010 roku. Pracowała w niepełnym wymiarze godzin przez dwa okresy swojej kariery.