W Istrian Spring Trophy 2018 w głównych klasyfikacjach przyznano trzy różne koszulki. W klasyfikacji generalnej , obliczonej poprzez dodanie czasów finiszowania poszczególnych kolarzy na poszczególnych etapach, lider otrzymał żółtą koszulkę. Ta klasyfikacja została uznana za najważniejszą w Istrian Spring Trophy 2018, a zwycięzca klasyfikacji został uznany za zwycięzcę wyścigu.
Dodatkowo przeprowadzono klasyfikację punktową , w której nagrodzono czerwoną koszulkę. W klasyfikacji punktowej kolarze otrzymywali punkty za zajęcie miejsca w pierwszej trójce w każdym sprincie pośrednim. Za zwycięstwo w sprincie pośrednim zawodnik zdobywał 5 punktów. Odbyła się również klasyfikacja górska , której prowadzenie wyznaczała zielona koszulka. W klasyfikacji górskiej punkty zdobywano za dotarcie na szczyt podjazdu przed innymi kolarzami, przy czym więcej punktów było dostępnych za podjazdy z wyższych kategorii.