Międzynarodowe Towarzystwo Ekologii Mikrobiologicznej

Międzynarodowe Towarzystwo Ekologii Mikrobiologicznej ( ISME ) jest głównym stowarzyszeniem naukowym zajmującym się rozwijającą się dziedziną ekologii drobnoustrojów i powiązanych z nią dyscyplin. ISME jest stowarzyszeniem non-profit i jest właścicielem International Symposia on Microbial Ecology, a także właścicielem The ISME Journal , który jest wydawany przez Springer Nature (współczynnik wpływu 2016 9,6 – Reuters Thomson). Biuro ISME ma swoją siedzibę w Holenderskim Instytucie Ekologii ( NIOO-KNAW ) w Wageningen w Holandii.

Cele

ISME wspiera wymianę informacji naukowej poprzez organizację międzynarodowych sympozjów i specjalistycznych warsztatów, sponsorowanie publikacji oraz promowanie edukacji i badań. ISME świadczy usługi zarówno dla środowiska naukowego, jak i szerszej społeczności. Towarzystwo ściśle współpracuje z innymi kluczowymi organizacjami naukowymi i nawiązało skuteczne interakcje naukowe we wszystkich regionach geograficznych za pośrednictwem sieci liderów naukowych, którzy pełnią funkcję krajowych ambasadorów ISME. Każdy, kto interesuje się ekologią drobnoustrojów, może zostać członkiem ISME.

Historia ekologii drobnoustrojów

Ważną rolę mikroorganizmów w środowisku naturalnym uznali pod koniec XIX wieku czołowi mikrobiolodzy, w szczególności M. Beijerinck i S. Winogradsky. W swoim wnikliwym wykładzie na temat roli drobnoustrojów w ogólnym obiegu życia (1897) 1 Winogradsky podkreślił kardynalną rolę mikroorganizmów w obiegu pierwiastków na ziemi. Omawiając zróżnicowanie mikroorganizmów w środowisku i interakcje mikrob-drobnoustroj między populacjami, zwrócił uwagę na wyspecjalizowane funkcje różnych mikroorganizmów w procesach obiegu materii oraz sukcesję różnych grup funkcyjnych w społeczności, w której działają. Jednak w epoce Winogradsky'ego i Beiuerincka jedynym sposobem rozróżniania i identyfikacji mikroorganizmów in situ była obserwacja mikroskopowa, a ilościowa analiza roli odgrywanej przez każdy mikroorganizm w społeczności była w większości przypadków nieosiągnięta.

W XX wieku, zwłaszcza po drugiej wojnie światowej, obserwujemy ogromny rozwój metod izolacji, liczenia i różnicowania mikroorganizmów w środowisku. Nowa metodologia w taksonomii, podobnie jak taksonomia numeryczna i chemotaksonomia, została wkrótce zastosowana do identyfikacji izolatów środowiskowych. Wprowadzono również metody barwienia różnicowego i techniki przeciwciał fluorescencyjnych do obserwacji mikroorganizmów in situ. Różne nowe techniki, począwszy od oznaczania wzrostu i aktywności mikroorganizmów w środowisku, po ich izolację i charakterystykę, zebrano w „Nowoczesnych metodach badań nad ekologią mikroorganizmów” pod redakcją Thomasa Rosswalla w 1973 roku). Książka powstała na podstawie spotkania, które odbyło się na Szwedzkim Uniwersytecie Nauk Rolniczych w Uppsali w 1972 r., a sympozjum, które poprzedziło formalne ISME, jest obecnie znane jako ISME-0 od czasu wystąpienia R. Guerrero na ISME-63).

Nowe metody i techniki okazały się skuteczne w analizie społeczności drobnoustrojów w różnych dziedzinach, takich jak mikrobiologia gleby i wody, konserwacja i fermentacja żywności oraz mikrobiologia medyczna. Mikrobiolodzy pracujący w różnych dziedzinach szybko zdali sobie sprawę z ujednoliconej koncepcji, ekologii drobnoustrojów. Praca T. Brocka „Principles of Microbial Ecology” z 1964 r.) wywarła głęboki wpływ na dalszy rozwój ekologii drobnoustrojów w różnych krajach.

Historia

Na podstawie szybkiego rozwoju ekologii drobnoustrojów, IAMS, Międzynarodowe Stowarzyszenie Towarzystw Mikrobiologicznych (zmodyfikowało swoją nazwę na IUMS po 1980 r.) postanowiło powołać ICOME, Międzynarodową Komisję Ekologii Mikrobiologicznej, na 10. Międzynarodowym Kongresie Mikrobiologii w Mexico City 1970. ICOME rozpoczął się w następnym roku.

Rolą podkreślaną przy powstaniu ICOME był aktywny udział w problemach środowiskowych, zanieczyszczaniu wód i gleb oraz niszczeniu środowiska przez działalność człowieka. Jednak lata po Meksyku pokazały, że zainteresowania Komitetu nie ograniczały się do problemów środowiskowych, ale rozszerzyły się na główne tematy ekologii drobnoustrojów, tj. obieg pierwiastków w glebie i osadach, interakcje między mikroorganizmami a roślinami, sami, wpływ czynników środowiskowych na wzrost i aktywność mikroorganizmów. Co więcej, ważna rola mikroorganizmów została doceniona przez naukowców zajmujących się wieloma dziedzinami aplikacyjnymi, kształtowaniem i żyznością gleby, zaopatrzeniem w wodę, fermentacją żywności i napojów, konserwacją żywności, przewodem pokarmowym i żwaczem, a nawet rozkładem starożytnych szczątków.

Pierwsze międzynarodowe sympozjum

Szybki i rozległy rozwój ekologii drobnoustrojów doprowadził do pierwszego Międzynarodowego Sympozjum Ekologii Mikroorganizmów. Liczba uczestników wzrosła z 380 z 30 krajów na pierwszym spotkaniu w Dunedin do 2000 z 65 krajów na ISME-11 w Wiedniu. Można powiedzieć, że ekologia drobnoustrojów stworzyła określoną niszę w świecie naukowym. Poszerzył się także zakres tematyczny. Oprócz centralnych tematów teoretycznych, w tematykę sympozjum weszły tematy z dziedzin stosowanych, takich jak bioremediacja, mikrobiologia medyczna, mikrobiologia żywności, gleby i wody. Mikroekologia przewodu pokarmowego pojawiła się po raz pierwszy na sesji sympozjum ISME-3, East Lansing, tematy dotyczące technologii fermentacji i flory jelitowej na ISME-4, Lublana, oraz mikrobiologii medycznej na ISME-5, Kioto. Tematy te nadal były ulubionymi tematami kolejnych sympozjów.

ICOME przez długi czas funkcjonował nieformalnie, a jego podstawową działalnością było organizowanie odbywających się co trzy lata międzynarodowych sympozjów. Jednak postęp i rozwój ekologii mikroorganizmów był tak szybki i przytłaczający, że musieliśmy jeszcze bardziej zintensyfikować rolę ICOME, która była międzynarodową komisją afiliowaną przy IUMS i IUBS, oraz ustanowić niezależną międzynarodową organizację opartą na ekologii drobnoustrojów.

Utworzono ISME

Było wiele przeszkód w przejściu z Komitetu do Towarzystwa. Jednak prof. J. Tiedje, który od 1995 roku pełnił funkcję Przewodniczącego ICOME, podjął aktywną inicjatywę utworzenia nowego Towarzystwa i konsultował się z różnymi organizacjami międzynarodowymi oraz z redaktorami i wydawcami czasopism. Zasugerował zmianę statusu ICOME na International Society of Microbial Ecology (ISME), które posiada własne czasopismo. Poprosił komitet wykonawczy ICOME o rozważenie i przedyskutowanie jego propozycji oraz przedstawienie dalszych kroków niezbędnych do założenia Towarzystwa. Zgodnie z jego planem Komitet Wykonawczy ustalił ramy Towarzystwa i czasopisma, w tym zakres, redakcję i politykę czasopisma.

Propozycja powołania Towarzystwa została przedstawiona i zatwierdzona na ISME-8 w Halifax, Kanada, 1998. Założenie ISME jest oczywiście ważnym krokiem dla przyszłego rozwoju ekologii mikroorganizmów i jesteśmy winni prof. Tiedje za jego niestrudzony wysiłek i cierpliwości w długim procesie tworzenia Towarzystwa. Stowarzyszenie założone i zarejestrowane w East Lancing, MI, USA, a później przeniesione i ma siedzibę w Genewie.

Tymczasem prof. Tiedje konsultował się ze Springerem, wydawcą czasopisma „Microbial Ecology”. W wyniku negocjacji Microbial Ecology związało się z nowo powstałym International Association for Microbial Ecology, wydawcą powołującym Redaktora i Radę Redakcyjną czasopisma w porozumieniu z ISME.

Liczba uczestników sympozjów ISME stale rosła. Na ISME-10 w Cancun w 2004 roku mieliśmy 2000 uczestników. Mikrobiolodzy pracujący w różnych dziedzinach zdali sobie sprawę z koncepcji ekologicznych, a nowe metody ewoluowały bardzo szybko. Biorąc pod uwagę wzrost liczby uczestników, bardzo szybki rozwój ekologii drobnoustrojów oraz szybko pojawiające się współczesne problemy, Towarzystwo postanowiło organizować sympozja co dwa lata po ISME-10.

Sympozja ISME

Dziś sympozja ISME, organizowane co dwa lata, są największymi międzynarodowymi spotkaniami poruszającymi szeroki zakres zagadnień z zakresu ekologii drobnoustrojów.

Poprzednie spotkania
Rok	Konferencja	Lokalizacja	Tytuł
2018	ISME-17	Lipsk - Niemcy	Innowacje w ekologii drobnoustrojów
2016	ISME-16	Montreal, Południowa Kanada	Ekologia drobnoustrojów
2014	ISME-15	Seul, Korea Południowa	Mikroby
2012	ISME-14	Kopenhaga, Dania	Siła małego
2010	ISME-13	Seattle, USA	Mikroby – zarządcy zmieniającej się planety
2008	ISME-12	Cairns, Australia	Utrzymanie niebieskiej planety
2006	ISME-11	Wiedeń, Austria	Ukryte moce – społeczności drobnoustrojów w akcji
2004	ISME-10	Cancún, Meksyk	Planeta mikrobiologiczna: pod powierzchnią do kosmosu
2001	ISME-09	Amsterdam, Holandia	Interakcje w świecie drobnoustrojów
1998	ISME-08	Halifax, Kanada	Biosystemy drobnoustrojów: nowe granice
1995	ISME-07	São Paulo, Brazylia	Postęp w ekologii drobnoustrojów
1992	ISME-06	Barcelona, Hiszpania	Trendy w ekologii drobnoustrojów
1989	ISME-05	Kioto, Japonia	Najnowsze postępy w ekologii drobnoustrojów
1986	ISME-04	Lublana, Słowenia	Perspektywy ekologii drobnoustrojów
1983	ISME-03	East Lansing, Stany Zjednoczone	Aktualne perspektywy w ekologii drobnoustrojów
1980	ISME-02	Warwick, Wielka Brytania	Współczesna ekologia drobnoustrojów
1977	ISME-01	Dunedin, Nowa Zelandia	Ekologia drobnoustrojów

Dziennik ISME

W maju 2007 roku International Society for Microbial Ecology (ISME) i Nature Publishing Group (NPG) wydały zupełnie nową publikację: The ISME Journal . Prof. Cohen, który był prezesem ISME od 2000 roku, wraz ze swoimi następcami prof. S. Kjellebergiem i prof . Czasopismo jest w pełni indeksowane przez Medline, a cała zawartość jest teraz hostowana w PubMed.

Obecny (2015) współczynnik wpływu czasopisma wynosi 9,3, a pełny tytuł czasopisma, The ISME Journal: Multidyscyplinarny Journal of Microbial Ecology, odzwierciedla zintegrowany charakter współczesnej ekologii drobnoustrojów, a cele i zakres czasopisma to odzwierciedlają.

Tematy szczególnie interesujące w zakresie czasopisma obejmują te wymienione poniżej:

I: Populacja drobnoustrojów i ekologia społeczności
II: Interakcje mikrob-mikrob i mikrob-gospodarz
III: Genetyka ewolucyjna
IV: Zintegrowane podejścia genomiczne i postgenomiczne w ekologii drobnoustrojów
V: Inżynieria mikrobiologiczna
VI: Geomikrobiologia i udział drobnoustrojów w cyklach geochemicznych
VII: Ekologia drobnoustrojów i zróżnicowanie funkcjonalne siedlisk przyrodniczych
VIII: Wpływ na ekosystem mikroorganizmów

Linki zewnętrzne