Międzynarodowy Ośrodek Koordynacyjny Neuroinformatyki

Międzynarodowy Ośrodek Koordynacyjny Neuroinformatyki
Skrót INCF
Tworzenie 2005 ; 18 lat temu ( 2005 )
Siedziba Sekretariat INCF
Lokalizacja
Współrzędne
Przewodniczący Rady Zarządzającej
 Maryann Martone
Strona internetowa incf .org

International Neuroinformatics Coordinating Facility ( INCF ) to międzynarodowa organizacja non-profit, której misją jest opracowywanie, ocena i zatwierdzanie standardów i najlepszych praktyk obejmujących zasady neuronauki Open, FAIR i Citable. INCF zapewnia również szkolenia na temat tego, w jaki sposób standardy i najlepsze praktyki ułatwiają odtwarzalność i umożliwiają publikowanie całości wyników badań, w tym danych i kodu. INCF powstał w 2005 roku na podstawie zaleceń grupy roboczej Global Science Forum OECD . INCF jest prowadzony przez Karolinska Institutet w Sztokholm , Szwecja . Sieć INCF obejmuje instytucje, organizacje, firmy i osoby prywatne zajmujące się neuroinformatyką, neuronauką, nauką o danych, technologią oraz polityką naukową i publikacją. Sieć jest zorganizowana w ciała zarządzające i grupy robocze, które koordynują różne kategorie globalnych działań neuroinformatycznych, które kierują i nadzorują rozwój i zatwierdzanie standardów i najlepszych praktyk, a także zapewniają szkolenia dotyczące tego, w jaki sposób standardy i najlepsze praktyki ułatwiają powtarzalność i umożliwiają publikowanie całość wyników badań, w tym dane i kod. Obecnymi dyrektorami są Mathew Abrams i Helena Ledmyr, a przewodniczącą Rady Zarządzającej jest Maryann Martone

Sieć INCF ma na celu promowanie stosowania podejść obliczeniowych do zrozumienia mózgu i rozwijanie infrastruktury wymaganej do korzystania z metod obliczeniowych w celu integracji i analizy różnorodnych danych w różnych skalach, technikach i gatunkach w celu zrozumienia mózgu i pozytywnego wpływu na zdrowie i dobre samopoczucie bycie społeczeństwem.

Tło

Zobacz też: Neuroinformatyka

Kluczowym elementem pomyślnego zrozumienia układu nerwowego jest integracja neuronauki z naukami informacyjnymi . Dziedzina zajmująca się badaniem układu nerwowego, neuronauka, odpowiedziała na fantastyczne wyzwanie zrozumienia, jak działa nasz mózg, przy użyciu najbardziej wyrafinowanych technologii, od badań nad genomem po techniki obrazowania mózgu zachowania ludzi i innych gatunków, w różnych stanach funkcjonalnych i na wszystkich pośrednich poziomach analitycznych. Wysiłek ten zaowocował ogromnymi ilościami danych, które stale rosną przy wyższych poziomach złożoności. Uzyskane dane są heterogeniczne i pochodzą z różnych poziomów badań i metod analizy. Aby sprostać wyzwaniu integracji oraz zapewnić efektywne i maksymalne wykorzystanie tych danych, konieczne jest obecnie opracowanie i utworzenie tych wspólnych zasobów:

  1. bazy danych i wiedzy neuronaukowej;
  2. narzędzia analityczne i modelujące; I
  3. modele obliczeniowe.

Wyzwaniu temu można sprostać poprzez połączenie neuronauki z informatyką – dziedziną neuroinformatyki.

Historia

Geneza

Zalecenie skoordynowania międzynarodowych wysiłków w nowej dziedzinie neuroinformatyki pojawiło się po raz pierwszy w raporcie na temat bioinformatyki opracowanym pod egidą ówczesnego OECD Megascience Forum w 1998 roku. Stephena H. Koslowa, propozycja powołania Międzynarodowej Rady Koordynacyjnej Neuroinformatyki oraz systemu grantowego finansowania badań neuroinformatycznych została następnie przedstawiona w 2002 roku. Projekt ten został zatwierdzony przez ministrów nauki OECD na spotkaniu w styczniu 2004 roku. Szesnaście krajów (Australia, Kanada , Chiny, Republika Czeska, Dania, Finlandia, Francja, Niemcy, Indie, Włochy, Japonia, Holandia, Norwegia, Szwecja, Szwajcaria, Zjednoczone Królestwo, Stany Zjednoczone i Wiktoria w Australii), a także Komisja Europejska, następnie opracował dokumenty robocze, które stanowią podstawę prawną dla INCF i Programu Międzynarodowej Neuroinformatyki (PIN).

Ustanowienie

Warunki utworzenia INCF zostały spełnione w lipcu 2005 r., kiedy to siedem krajów (Czechy, Finlandia, Niemcy, Norwegia, Szwecja, Szwajcaria i Stany Zjednoczone) podpisało porozumienie i zadeklarowało wkład finansowy. Ogłoszono przetarg na organizację Sekretariatu INCF. Otrzymano dwie propozycje i zgodnie z instrukcją Rady Zarządzającej 3 listopada OECD zwołała panel ekspertów w celu dokonania przeglądu i oceny propozycji. Panel przyznał szwedzkiej propozycji wyższy stopień, a Rada Zarządzająca INCF zatwierdziła tę rekomendację podczas spotkania w siedzibie OECD 28 listopada. Po szeroko zakrojonych dyskusjach międzynarodowych INCF został oficjalnie zainaugurowany w lutym 2007 r. Karolinska Institute w Sztokholmie.

INCF promuje współpracę w neuroinformatyce i odtwarzalność w badaniach mózgu

  • zapewnianie koordynacji globalnej infrastruktury neuronauki poprzez opracowywanie i zatwierdzanie standardów i najlepszych praktyk wspierających otwartą i FAIR (Findable Accessible Interoperable Reusable) neuronaukę ( dane FAIR )
  • szkolenie naukowców, administratorów i studentów w zakresie, w jaki neuroinformatyka promuje rygor i odtwarzalność, otwartą i UCZCIWĄ naukę oraz publikowanie całości wyników ich badań: narracji, danych i kodu
  • zachęcanie neuronauki jako dyscypliny do przejścia w kierunku SIŁY (FAIR, Open, Research-obiekt-based, and Citable Ecosystem)
  • promowanie postępu i dalszego rozwoju neuroinformatyki jako dyscypliny naukowej

Kluczowe rezultaty programu

włączać

  • Przestrzeń Waxholma (WHS), oparta na współrzędnych przestrzeń odniesienia mózgu gryzoni
  • Scalable Brain Atlas, internetowy silnik wyświetlania atlasów mózgu, danych obrazowania i topologii
  • NineML, ogólny język opisu modeli
  • Multi-Simulation Coordinator (MUSIC), który pozwala wielkoskalowym symulatorom neuronów i innym aplikacjom komunikować się w czasie pracy
  • Neuroimaging Informatics Data Model (NI-DM), platforma do generowania, przechowywania i wyszukiwania metadanych, w tym informacji o pochodzeniu
  • KnowledgeSpace, społecznościowa encyklopedia łącząca koncepcje badań mózgu z danymi, modelami i literaturą z całego świata
  • TrainingSpace, repozytorium online łączące zasoby szkoleniowe w zakresie neuroinformatyki opracowane zarówno przez INCF, naszych partnerów, jak i istniejące zasoby społeczności.

Zobacz też

Linki zewnętrzne

Pobrane z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=International_Neuroinformatics_Coordinating_Facility&oldid=1035288035 ”