Miękka zgnilizna Enterobacteriaceae (SRE) małe RNA

Miękka zgnilizna Enterobacteriaceae ( SRE ) (obejmująca rodzaje Erwinia , Pectobacterium , Dickeya i Pantoea ) to wszechobecne nekrotroficzne patogeny bakteryjne , które infekują wiele różnych gatunków roślin na całym świecie, w tym ważne gospodarczo uprawy.

Kiedy żyją w glebie poza roślinnymi żywicielami, głodują i muszą przystosować się do nowych warunków. Wykorzystując analizę sekwencji RNA specyficzną dla nici i przewidywania sRNA in silico, zidentyfikowano 137 kandydatów na małe RNA w Pectobacterium atrosepticum w warunkach głodu. Sugeruje to, że sRNA odgrywają rolę w odpowiedzi adaptacyjnej bakterii. Ekspresję 9 nowych kandydujących sRNA potwierdzono metodą RT-PCR. Obejmowały one antysensowne RNA i regiony UTR .