Motyw RNA RMF

rmf RNA
Rmf-RNA.svg
Konsensusowa struktura drugorzędowa rmf RNA
Identyfikatory
Symbol rmf RNA
Rfam RF01755
Inne dane
typ RNA Cis -element regulujący
Domeny Bakteria
Struktury PDB PDBe

Motyw rmf RNA to konserwatywna struktura RNA , którą pierwotnie wykryto za pomocą bioinformatyki . RNA rmf są konsekwentnie znajdowane w gatunkach sklasyfikowanych w rodzaju Pseudomonas i są potencjalnie zlokalizowane w nieulegających translacji regionach 5' (5' UTR) genów rmf . Geny te kodują białko czynnika modulacji rybosomów , które wpływa na translację genów poprzez modyfikację struktury rybosomu w odpowiedzi na stres, taki jak głód. Ta modulacja rybosomów jest częścią ścisłej odpowiedzi bakterii . Prawdopodobna rola biologiczna rmf RNA jest niejednoznaczna. Ponieważ RNA może znajdować się w 5' UTR genów kodujących białka, postawiono hipotezę, że działa jako element cis-regulatorowy . Hipotezę tę potwierdza obserwacja, że ​​czynnik modulacji rybosomów wiąże rybosomalny RNA , a wiele cis -regulatorowych RNA zwanych rybosomalnymi liderami białkowymi uczestniczą w mechanizmie regulacji ze sprzężeniem zwrotnym, wiążąc się z białkami, które normalnie wiążą się z rybosomalnym RNA. Ponieważ jednak rmf nie są bardzo zbliżone do genów rmf , mogą działać jako niekodujące RNA .

Linki zewnętrzne