motyw rne-II RNA
| rne-II RNA | |
|---|---|
 Konsensusowa struktura drugorzędowa RNA rne -II
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | rne-II RNA |
| Rfam | RF01756 |
| Inne dane | |
| typ RNA | Cis -element regulujący |
| Domeny | Pseudomonadaceae |
| Struktury PDB | PDBe |
Motyw rne -II RNA jest konserwatywną strukturą RNA zidentyfikowaną za pomocą bioinformatyki . Wykrywa się go tylko u gatunków należących do rodziny Pseudomonadaceae , grupy gammaproteobacteria . RNA rne -II są konsekwentnie zlokalizowane w przypuszczalnie nieulegających translacji regionach 5' (5' UTR) genów kodujących rybonukleazę E (RNazę E). Element RNazy E 5' UTR jest wcześniej zidentyfikowaną strukturą RNA, która znajduje się również w 5' UTR genów RNazy E. Jednak ten ostatni motyw występuje tylko u enterobakterii , a oba motywy mają pozornie niezwiązaną strukturę. Ze względu na różnice postawiono hipotezę, że rne -II pełnią taką samą rolę funkcjonalną jak elementy RNazy E 5' UTR, czyli regulują poziomy białek RNazy E działając jako substrat dla RNazy E. RNazy E są wysokie, degradują swój własny informacyjny RNA .
Linki zewnętrzne