Motyw wiążący kalmodulinę IQ
| Motyw wiążący kalmodulinę IQ | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura domeny regulacyjnej miozyny przegrzebka w rozdzielczości 2 A.
| |||||||||||
| Identyfikatory | |||||||||||
| Symbol | ILORAZ INTELIGENCJI | ||||||||||
| Pfam | PF00612 | ||||||||||
| InterPro | IPR000048 | ||||||||||
| MĄDRY | SM00015 | ||||||||||
| PROZYTA | PS50096 | ||||||||||
| SCOP2 | 1wdc / ZAKRES / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
Motyw wiążący kalmodulinę IQ to motyw sekwencji aminokwasowej zawierający następującą sekwencję:
- [FILV]Qxxx[RK]Gxxx[RK]xx[FILVWY]
Termin „IQ” odnosi się do pierwszych dwóch aminokwasów motywu: izoleucyny (powszechnie) i glutaminy (niezmiennie).
Funkcjonować
Kalmodulina (CaM) jest uznawana za główny czujnik wapnia (Ca 2+ ) i koordynator zdarzeń regulacyjnych poprzez oddziaływanie z różnorodną grupą białek komórkowych. Dla wielu znanych białek wiążących CaM istnieją trzy klasy motywów rozpoznawczych; motyw IQ jako konsensus dla wiązania niezależnego od Ca2 + i dwa pokrewne motywy dla wiązania zależnego od Ca2 + , określane jako 1-14 i 1-5-10 w oparciu o pozycję konserwatywnych reszt hydrofobowych .
Przykład
Domena regulatorowa miozyny przegrzebka jest trójłańcuchowym kompleksem białkowym, który włącza ten silnik w odpowiedzi na wiązanie Ca 2+ . Interakcje łańcuchów bocznych łączą dwa łańcuchy lekkie w tandemie z sąsiednimi segmentami łańcucha ciężkiego niosącymi motyw sekwencji IQ. Ca 2+ jest nowym motywem ręki EF na podstawowym łańcuchu lekkim i jest stabilizowane przez wiązania obejmujące łańcuch ciężki i oba łańcuchy lekkie, co odpowiada wymaganiom wszystkich trzech łańcuchów dla wiązania i regulacji Ca 2+ w nienaruszonym stanie cząsteczka miozyny.