Motywy RNA PhotoRC

Konsensusowa struktura drugorzędowa RNA PhotoRC-I i RNA PhotoRC-II. Ta liczba jest adaptacją poprzedniej publikacji. Struktury te są reprezentowane przez rodziny Rfam RF01716 i RF01717

Motywy RNA PhotoRC odnoszą się do konserwatywnych struktur RNA , które są związane z genami działającymi w fotosyntetycznym centrum reakcji bakterii fotosyntetyzujących . Zidentyfikowano dwie takie klasy RNA i nazwano je motywami PhotoRC-I i PhotoRC-II. RNA PhotoRC-I wykryto w genomach niektórych sinic . Chociaż nie wykryto RNA PhotoRC-II w sinicach, znaleziono je w genomie oczyszczonego faga który infekuje cyjanobakterie. Zarówno RNA PhotoRC-I, jak i PhotoRC-II są obecne w sekwencjach pochodzących z DNA , które zostało wyekstrahowane z niehodowanych bakterii morskich .

RNA motywu PhotoRC znajdują się powyżej i prawdopodobnie w nieulegających translacji regionach 5 ' (5' UTR) genów, które czasami są opisywane jako psbA . Białka kodowane przez geny psbA tworzą centrum reakcji kompleksu fotosystemu II . Zaproponowano, że RNA PhotoRC są elementami cis-regulatorowymi działającymi na poziomie RNA, ponieważ bakteryjne cis -regulatorowe RNA zazwyczaj znajdują się w 5' UTR.

Linki zewnętrzne

• Strona dla PhotoRC-I w Rfam
• Strona dla PhotoRC-II w Rfam