Nadrodzina BART

Nadrodzina transporterów żółci/arsenitu/ryboflawiny (BART) to nadrodzina wszechobecnych białek transportowych . Od początku 2016 roku nadrodzina zawiera siedem uznanych rodzin. Dostępne są dane funkcjonalne dla członków wszystkich tych rodzin. Siedem rodzin znajduje się w bazie danych klasyfikacji transporterów z następującymi numerami TC, nazwami i skrótami:

  • TC# 2.A.10 — Rodzina transporterów 2-keto-3-dezoksyglukonianu (KdgT)
  • TC# 2.A.28 — Rodzina kwasów żółciowych: Na+ Symporter (BASS).
  • TC# 2.A.59 — Rodzina Arsenical Resistance-3 (ACR3).
  • TC # 2.A.69 - Rodzina Auxin Efflux Carrier (AEC).
  • TC# 2.A.87 — Rodzina prokariotycznych transporterów ryboflawiny (P-RFT)
  • TC# 9.B.33 - Rodzina czujników kinazy histydynowej (SHK).
  • TC# 9.B.34 ​​— Rodzina kinazy/fosfatazy/syntazy cyklicznej GMP/hydrolazy cyklicznej di-GMP (KPSH)

Pierwsze zidentyfikowane substraty dla transporterów w pierwszych 5 rodzinach są oznaczone nazwami rodzin, ale wszystkie te rodziny transportują różne inne substraty. Większość członków białek z pierwszych czterech z tych rodzin wykazuje prawdopodobną topologię 10 kluczy transbłonowych (TMS), która powstała z tandemowo zduplikowanej jednostki 5 TMS. Uważa się, że N- i C-końce znajdują się w cytoplazmie komórek bakteryjnych i to samo może dotyczyć również większości innych członków. Członkowie rodziny RFT mają topologię 5 TMS i są homologiczni do każdej z dwóch jednostek powtórzeń w 10 białkach TMS. Pozostałe dwie rodziny [czujnikowa kinaza histydynowa (SHK) i kinaza/fosfataza/syntetaza/hydrolaza (KPSH)] mają pojedynczą jednostkę 5 TMS poprzedzoną N-końcowym TMS, a następnie hydrofilową domenę sensoryczną kinazy histydynowej (rodzina SHK) lub domeny katalityczne przypominające kinazę czujnikową, fosfatazę, syntetazę cyklicznego di-guanylanu (GMP) i domeny katalityczne cyklicznej hydrolazy di-GMP, jak również różne domeny niekatalityczne (rodzina KPSH). Ponieważ dane funkcjonalne nie są dostępne dla domen transbłonowych członków rodzin SHK i KPSH, nie wiadomo, czy te domeny podobne do transporterów zachowują aktywność transportową lub wyewoluowały wyłączne funkcje w odbiorze molekularnym i transmisji sygnału. Mogą służyć jedynie do zakotwiczenia domen katalitycznych w błonie. Więcej informacji można znaleźć w TCDB.