Nadrodzina Holin IV
Nadrodzina Holin IV to nadrodzina integralnych białek transportujących błonę . Jest to w sumie jedna z siedmiu różnych nadrodzin holinów .
Nadrodzina Holin IV obejmuje rodziny TC:
- 1.E.10 - Rodzina Bacillus subtilis φ29 Holin (φ29 Holin)
- 1.E.16 - Rodzina Cph1 Holin (Cph1 Holin).
- 1.E.19 — Rodzina Clostridium difficile TcdE Holin (TcdE Holin)
- 1.E.40 - Rodzina Mycobacterial 4 TMS Phage Holin (MP4 Holin)
Nadrodzina IV obejmuje cztery rodziny TC, które obejmują członków z Bacillota , Actinomycetota i Fusobacteriota . Ich średnie rozmiary to (w resztach aminoacylowych (aas)):
TC# 1.E.10 - 138 ± 6 aas
TC# 1.E.16 - 149 ± 15 aas
TC# 1.E.19 - 141 ± 12 aas
TC# 1.E.40 - 173 ± 149 aas
Tak więc istnieje bardzo mała zmienność wielkości wśród członków rodziny, z wyjątkiem rodziny 40, która ma członków większych niż inne białka w tej nadrodzinie. Wydaje się, że wszyscy członkowie rodzin 10 i 19 oraz wielu członków rodziny 16 mają 3 segmenty transbłonowe (TMS), ale przewiduje się, że niektórzy członkowie tej ostatniej rodziny mają 4 TMS. Dodatkowy TMS w tych białkach znajduje się na ich N-końcach.
Zobacz też