PAUP*
 | |
| Oryginalni autorzy | Davida L. Swofforda |
|---|---|
| Wersja stabilna | 4.0b10 |
| Wersja podglądu | 4.0a164 |
| Napisane w | C |
| System operacyjny | Macintosh, Windows, Unix |
| Platforma | Międzyplatformowe |
| Typ | nauka |
| Licencja | quasi-komercyjny |
| Strona internetowa | PAUP* |
PAUP* ( P hylogenetic A nalysis using P arsimony * and other Methods) to obliczeniowy program filogenetyczny służący do wnioskowania o drzewach ewolucyjnych ( filogenie ), napisany przez Davida L. Swofforda . Pierwotnie, jak sama nazwa wskazuje, PAUP implementował tylko parsimony , ale od wersji 4.0 (kiedy program stał się znany jako PAUP*) obsługuje również metody macierzy odległości i wiarygodności . Wersja 3.0 działała na komputerach Macintosh komputerów i obsługiwał bogaty, przyjazny dla użytkownika interfejs graficzny. Wraz z programem MacClade, z którym współdzieli format danych NEXUS , PAUP* był oprogramowaniem filogenetycznym wybieranym przez wielu filogenetyków.
Wersja 4.0 dodała obsługę platform Windows (powłoka graficzna i wiersz poleceń) oraz Unix (tylko wiersz poleceń). Jednak graficzny interfejs użytkownika dla komputerów Macintosh nie obsługuje wersji systemu Mac OS X wyższych niż 10.14 (chociaż planowane jest GUI dla nowszych wersji systemu Mac OS). PAUP* jest również dostępny jako wtyczka do Geneious. PAUP*, który teraz nosi samoreferencyjny tytuł PAUP* (* Analiza filogenetyczna za pomocą PAUP), przechodzi szybkie aktualizacje i obejmuje teraz metodę „drzewa gatunków” SVDquartets, oprócz metod oszczędności, prawdopodobieństwa i odległości dla filogenetyki .