Phylosan
| Deweloperzy | Wadsworth Center, Departament Zdrowia Stanu Nowy Jork |
|---|---|
| Pierwsze wydanie | 14 marca 2005 |
| Wersja stabilna | 2.2 / 28 stycznia 2010
|
| Platforma | Serwis internetowy |
| Dostępne w | język angielski |
| Typ | Narzędzie bioinformatyczne |
| Strona internetowa | http://ccmbweb.ccv.brown.edu/cgi-bin/phylocanV2.pl |
Phylocan to usługa internetowa do analizy sekwencji DNA , która jest bezpłatna i otwarta dla wszystkich użytkowników (bez wymogu logowania). Aby zlokalizować dopasowania do określonego przez użytkownika motywu sekwencji dla regulatorowego miejsca wiązania , Phylocan zapewnia statystycznie czuły skan dostarczonych przez użytkownika mieszanych, wyrównanych i niewyrównanych danych sekwencji DNA. Siłą Phylocan jest to, że łączy
- metoda Stadena do obliczania istotności statystycznej ,
- funkcja skanowania „modelu motywu filogenetycznego” oprogramowania MONKEY, która modeluje relacje ewolucyjne między dopasowanymi sekwencjami,
- wykorzystanie metody Baileya i Gribskova do łączenia statystyk z danych o niewyrównanych sekwencjach oraz
- technika Neuwald & Green do łączenia statystyk w wielu miejscach wiązania znalezionych w pojedynczym regionie promotora genu.