Przeglądarka genomu

W bioinformatyce przeglądarka genomu jest graficznym interfejsem do wyświetlania informacji z biologicznej bazy danych danych genomowych. Przeglądarki genomu umożliwiają naukowcom wizualizację i przeglądanie całych genomów za pomocą danych z adnotacjami, w tym przewidywania i struktury genów, białek, ekspresji, regulacji, zmienności, analizy porównawczej itp. Dane z adnotacjami pochodzą zwykle z wielu różnych źródeł. Różnią się one od zwykłych biologicznych baz danych tym, że wyświetlają dane w formacie graficznym, ze współrzędnymi genomu na jednej osi z adnotacjami lub grafiką wypełniającą przestrzeń, aby pokazać analizy genów, takie jak częstotliwość genów, ich profile ekspresji itp.

Dostępna jest duża liczba przeglądarek genomu, wiele z nich jest bezpłatnych iz bazami danych dostępnymi online. Do najbardziej znanych należą UCSC Genome Browser , Ensembl Genome Browser i NCBI 's Genome Data Viewer. Te przeglądarki genomu mogą obsługiwać wiele genomów, jednak inne przeglądarki genomu mogą być specyficzne dla określonych gatunków. Przeglądarki te mogą dostarczać podsumowania danych z genomicznych baz danych i ocenę porównawczą różnych sekwencji genetycznych u wielu gatunków, a także umożliwiać wizualizację danych na różne sposoby, aby ułatwić ocenę i interpretację tych złożonych danych.