W związku z pandemią COVID-19 wszystkie mecze kolejek 3 i 4 zaplanowane na marzec 2020 zostały przełożone do odwołania. FIFA zaleciła przełożenie wszystkich meczów międzynarodowych w czerwcu 2020 r. (5. kolejka), a także przełożyła wrzesień 2020 r. (6. kolejka) dla CAF.
W dniu 30 czerwca 2020 r. CAF ogłosił, że turniej finałowy Pucharu Narodów Afryki 2021 został przełożony ze stycznia 2021 r. Na styczeń 2022 r., Nie ogłaszając nowych terminów pozostałych eliminacji. W dniu 19 sierpnia 2020 r. CAF ogłosił nowe daty pozostałych eliminacji, przy czym kolejki 3 i 4 zostały przełożone na 9–17 listopada 2020 r., A kolejki 5 i 6 przełożone na 22–30 marca 2021 r.
Maroko i Mauretania, odpowiednio zwycięzcy grup i wicemistrzowie, zakwalifikowali się do Pucharu Narodów Afryki 2021.