RNA MicF
| MicF RNA | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji MicF
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | Mikrofon F |
| Rfam | RF00033 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; antysensowny |
| Domeny | Bakteria |
| IŚĆ | GO:0006950 GO:0003729 |
| WIĘC | SO: 0000383 |
| Struktury PDB | PDBe |
micF RNA to niekodujący gen odpowiedzi na stres RNA występujący w Escherichia coli i pokrewnych bakteriach, który potranskrypcyjnie kontroluje ekspresję genu poriny błony zewnętrznej ompF. Gen micF koduje nieulegający translacji antysensowny RNA o długości 93 nukleotydów , który wiąże swój docelowy mRNA ompF i reguluje ekspresję ompF poprzez hamowanie translacji i indukowanie degradacji wiadomości. Ponadto inne czynniki, takie jak białko opiekuńcze RNA StpA, również odgrywają rolę w tym systemie regulacyjnym. Ekspresja micF jest kontrolowana zarówno przez środowiskowe, jak i wewnętrzne czynniki stresowe. Wiadomo, że cztery regulatory transkrypcji wiążą region promotora micF i aktywują ekspresję micF.
Rozmieszczenie gatunków
Homologi RNA MicF scharakteryzowano metodą Southern blotting w różnych bakteriach, w tym Salmonella typhimurium , Klebsiella pneumoniae i Pseudomonas aeruginosa . MicF został również zidentyfikowany obliczeniowo w Yersinia pestis i Yersinia enterocolitica .