Repozytorium danych z badań nad genomiką i fenomenem roślin e!DAL

Repozytorium danych badawczych dotyczących genomiki i fenomiki roślin (PGP) to infrastruktura publikacji danych służąca do kompleksowego publikowania wielodomenowych danych badawczych dotyczących roślin. Jest prowadzony w Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plant Research (IPK) w Gatersleben w Niemczech. Repozytorium przechowuje zbiory danych, które można cytować w DOI, które nie są publikowane w repozytoriach publicznych ze względu na ich objętość lub zakres danych. PGP umożliwia publikację zbiorów danych w skali gigabajtów i jest zarejestrowany jako repozytorium danych badawczych na FAIRSharing.org, re3data.org i OpenAIRE jako ważne otwarte archiwum danych programu „Horyzont 2020” UE. Powyższe cechy, programistyczny interfejs i obsługa standardowych formatów metadanych umożliwiają PGP spełnienie danych FAIR — możliwe do znalezienia, dostępne, interoperacyjne, wielokrotnego użytku. Repozytorium PGP zostało utworzone przy użyciu infrastruktury oprogramowania e!DAL i stosuje on-premises w celu „doprowadzenia infrastruktury do danych” (I2D).

Zawartość danych

Wszystkie przesłane i zatwierdzone dane są przechowywane w IPK Gatersleben i są stabilnie cytowane w dłuższej perspektywie przez DOI. Wszystkie zestawy danych są połączone w ORCID i indeksowane przez wszystkie główne wyszukiwarki internetowe. Repozytorium PGP jest akceptowane przez takie czasopisma jak GigaScience i Nature Scientific Data jako zalecane repozytorium danych. Wszystkie opublikowane zestawy danych można przeglądać w aplikacji do raportowania danych PGP lub wyszukiwać za pomocą DataCite .

Przekazywanie danych

Repozytorium PGP przyjmuje zgłoszenia od europejskiej społeczności naukowców zajmujących się roślinami. Internetowe narzędzie do przesyłania małych zestawów danych oraz Java do przesyłania pakietów danych w skali gigabajtów na komputery stacjonarne wykorzystują infrastrukturę uwierzytelniania i autoryzacji ELIXIR (AAI). Proces przeglądu zapewnia techniczną jakość przekazywanych danych.

Niemiecka Sieć Infrastruktury Bioinformatycznej (de.NBI)

Repozytorium PGP jest częścią portfolio usług węzła German Crop BioGreenformatics Network (GCBN) niemieckiej sieci infrastruktury bioinformatycznej .

Linki zewnętrzne