Rodzina glukozy-glukozydów PTS (Glc).
Rodzina PTS glukozy-glukozydów (Glc) ( TC# 4.A.1 ) obejmuje portery specyficzne dla glukozy, glukozaminy, N-acetyloglukozaminy i wielu różnych α- i β-glukozydów i jest częścią nadrodziny PTS -GFL .
Homologia
Nie wszystkie portery β-glukozydowe PTS należą do tej klasy, ponieważ porter PTS opisany po raz pierwszy jako celobiozowy porter β-glukozydowy to porter diacetylochitobiozowy z rodziny Lac . Domeny IIA, IIB i IIC wszystkich wymienionych poniżej grup translokatorów są wyraźnie homologiczne. Te portery (domeny IIC) wykazują ograniczone podobieństwo sekwencji z członkami rodziny Fru i są do nich homologiczne a mniej z członkami rodziny Lac. Domeny IIC podrodzin glukozy i glukozydów są od siebie tak odległe, jak od rodzin Fru, Mtl i Lac. Podobnie jak w przypadku innych członków nadrodziny PTS-GFL, domeny IIC tych permeaz prawdopodobnie mają jednolitą topologię 10 TMS.
Struktura i funkcja
Wyjaśniono trójwymiarowe struktury domen IIA i IIB portera glukozy Escherichia coli . IIA glc ma złożoną strukturę β-kanapkową, podczas gdy IIB glc jest podzieloną αβ-kanapkową z topologią niezwiązaną z podzieloną strukturą αβ-kanapkową HPr. Niektóre bakterie mają wiele systemów transportu PTS należących do różnych rodzin. Na przykład rozpuszczalnikogenne Clostridium acetobutylicum ATCC 824 ma łącznie 13, w tym 6 w rodzinie Glc, 2 w rodzinie Fru, 2 w rodzinie Lac, 1 w rodzinie Gat i 2 w rodzinie Man.
Kilku porterów PTS z rodziny Glc nie ma własnych domen IIA i zamiast tego używa białka glukozy IIA (IIA glc lub Crr). Większość z tych porterów ma domeny B i C połączone ze sobą w pojedynczy łańcuch polipeptydowy. Reszta cysteinowa w domenie IIB jest fosforylowana przez bezpośrednie przeniesienie fosforylu z IIA glc (his~P) lub jednego z jego homologów. Te portery, które nie mają domeny IIA, obejmują portery maltozowe, arbutynowo-salicyno-celobiozowe, trehalozę, domniemane glukozydy i sacharozę z E. coli. Większość, ale nie wszystkie portery Scr innych bakterii również nie mają domeny IIA.
BglF składa się z domeny transbłonowej, która oprócz TMS zawiera dużą pętlę cytoplazmatyczną. Według Yagura-Krolla i in. , ta pętla, łącząca TMS 1 z TMS 2, zawiera regiony, które zmieniają się między stanami skierowanymi do wewnątrz i skierowanymi na zewnątrz i tworzy kanał translokacji cukru. Yagur-Kroll i in. wykazać bliskość przestrzenną między pozycjami w środku dużej pętli a miejscem fosforylacji, co sugeruje, że te dwa regiony spotykają się, aby przeprowadzić fosfotransfer cukru.
Linki zewnętrzne
- Rodzina PTS glukozy-glukozydów (Glc) (baza danych klasyfikacji transporterów, Saier Lab Group, UCSD)
Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treść z „4.A.1 The PTS Glucose-Glucoside (Glc) Family” , która jest objęta licencją umożliwiającą ponowne wykorzystanie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License GFDL . _ Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.