Rodzina plastocyjanin białek wiążących miedź

Białka wiążące miedź, rodzina plastocyjaniny/azuryny
PDB 1plc EBI.jpg
Struktura plastocyjaniny topoli.
Identyfikatory
Symbol Oprawa miedziana
Pfam PF00127
InterPro IPR000923
PROZYTA PDOC00174
SCOP2 1plc / ZAKRES / SUPFAM
Nadrodzina OPM 93
Białko OPM 1sfd
CDD cd00920
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury

Rodzina białek wiążących miedź plastocyjaniny / azuryny (lub niebieska domena miedzi (typ 1) ) to rodzina małych białek, które wiążą pojedynczy atom miedzi i charakteryzują się intensywnym pasmem absorpcji elektronowej w pobliżu 600 nm (patrz białka miedzi ). Najbardziej znanymi przedstawicielami tej klasy białek są roślinne chloroplastyczne plastocyjaniny , które wymieniają elektrony z cytochromem c6, oraz daleko spokrewnione bakteryjne azuryny , które wymieniają elektrony z cytochromem c551. Ta rodzina białek obejmuje również amicyjaninę z bakterii, takich jak Methylobacterium extorquens lub Paracoccus versutus (Thiobacillus versutus), które mogą rosnąć na metyloaminie; auracyjany A i B z Chloroflexus aurantiacus ; białko niebieskiej miedzi z Alcaligenes faecalis ; kupredoksyna (CPC) z Cucumis sativus (Ogórek); kuzacyjanina (podstawowe białko niebieskie; plantacyjanina, CBP) z ogórka; halocyjanina z Natronomonas pharaonis (Natronobacterium pharaonis), białko wiążące miedź związane z błoną; pseudoazuryna z Pseudomonas; rusticyanin z Thiobacillus ferrooxidans ; stellacyjanina z Rhus vernicifera (japońskie drzewo lakowe); umecyjanina z korzeni Armoracia rusticana (chrzan); oraz alergen Ra3 z ambrozji. To białko pyłku ma ewolucyjny związek z powyższymi białkami, ale wydaje się, że utraciło zdolność wiązania miedzi. Chociaż istnieje znaczna rozbieżność w sekwencjach wszystkich tych białek, miejsca ligandów miedzi są zachowane.