Syntaza spermidyny
| syntaza spermidyny | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 tetramer syntazy spermidyny,
| |||||||
| identyfikatory Bacillus subtilis | |||||||
| Symbol | SRM | ||||||
| Alt. symbolika | SRML1 | ||||||
| gen NCBI | 6723 | ||||||
| HGNC | 11296 | ||||||
| OMIM | 182891 | ||||||
| RefSeq | NM_003132 | ||||||
| UniProt | P19623 | ||||||
| Inne dane | |||||||
| numer WE | 2.5.1.16 | ||||||
| Umiejscowienie | Chr. 1 s. 36-s. 22 | ||||||
| |||||||
Syntaza spermidyny jest enzymem ( EC 2.5.1.16 ), który katalizuje przeniesienie grupy propyloaminowej z S -adenozylometioninoaminy do putrescyny w biosyntezie spermidyny . Nazwa systematyczna to S-adenozylo 3-(metylotio)propyloamina:putrescyna 3-aminopropylotransferaza i należy do grupy transferaz aminopropylowych. Nie potrzebuje żadnych kofaktorów. Większość syntaz spermidyny występuje w roztworze jako dimery.
Specyficzność
Z wyjątkiem syntaz spermidyny z Thermotoga maritimum i Escherichia coli , które akceptują różne rodzaje poliamin, wszystkie enzymy są wysoce specyficzne dla putrescyny. Żadna znana syntaza spermidyny nie może wykorzystywać S -adenozylometioniny . Zapobiega temu konserwowana reszta aspartylowa w miejscu aktywnym, o której uważa się, że odpycha ugrupowanie karboksylowe S -adenozylometioniny. Putrescyno -N-metylotransferaza, której substratami są putrescyna i S -adenozylometionina, która jest ewolucyjnie spokrewniona z syntazami spermidyny, nie ma tej reszty aspartylowej. Możliwe jest nawet przekształcenie syntazy spermidyny przez pewne mutacje w funkcjonalną putrescyno-N-metylotransferazę.
Mechanizm
mechanizmem Sn2 , że synteza spermidyny przebiega zgodnie z . Istnieje pewna niepewność, czy reakcja zachodzi za pośrednictwem ping-ponga , czy za pośrednictwem mechanizmu trójskładnikowego . Niektóre dane kinetyczne, ale nie wszystkie, sugerują mechanizm ping-ponga, podczas gdy badanie stereochemicznej ścieżki reakcji przemawia za mechanizmem trójskładnikowym. Przed nukleofilowym atakiem putrescyny na S -adenozylometioninamina putrescyna musi zostać zdeprotonowana, czyniąc azot nukleofilowym, ponieważ putrescyna jest protonowana w fizjologicznym pH i dlatego jest nieaktywna.
Inhibitory
Syntaza spermidyny może być hamowana przez wiele różnych analogów putrescyny, S -adenozylometionaminy i analogów stanu przejściowego, takich jak Adodato (więcej informacji znajduje się tutaj )
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- Syntaza spermidyny w firmie BRENDA
- Syntaza spermidyny w ExPASy
- Spermidyna + syntaza w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
