Droga polipirymidynowa

Zasadniczy składnik spliceosomu U2AF związany z krótkim fragmentem polipirymidynowego RNA.

Przewód polipirymidynowy to region pre-messenger RNA (mRNA), który promuje składanie spliceosomu , kompleksu białkowego specjalizującego się w przeprowadzaniu składania RNA podczas procesu modyfikacji potranskrypcyjnej . Region jest bogaty w nukleotydy pirymidynowe , zwłaszcza uracyl , i ma zwykle długość 15–20 par zasad , umiejscowiony około 5–40 par zasad przed końcem 3' intronu do łączenia.

Szereg czynników białkowych wiąże się z szlakiem polipirymidynowym lub wiąże się z nim, w tym składnik spliceosomu U2AF i białko wiążące przewód polipirymidynowy (PTB), które odgrywa rolę regulacyjną w alternatywnym splicingu . Podstawową funkcją PTB jest eksonu , w wyniku którego pomija się określony region eksonu normalnie wstawiony do dojrzałego mRNA, co powoduje ekspresję izoformy białka , dla którego koduje mRNA . Ponieważ PTB ulega wszechobecnej ekspresji u wielu wyższych eukariontów uważa się, że hamuje włączenie „słabych” eksonów ze słabo zdefiniowanymi miejscami splotu . Jednakże wiązanie PTB nie jest wystarczające do tłumienia „solidnych” eksonów.

Supresja lub selekcja eksonów ma kluczowe znaczenie dla właściwej ekspresji izoform specyficznych tkankowo . Na przykład mięśnie gładkie i mięśnie szkieletowe wyrażają alternatywne izoformy wyróżniające się wzajemnie wykluczającą selekcją eksonów w alfa- tropomiozynie .

^ Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004). Biologia molekularna komórki. WH Freeman: Nowy Jork, NY. 5. wyd.
^ Wagner EJ, Garcia-Blanco MA. (2001). Białko wiążące przewód polipirymidynowy antagonizuje definicję eksonu. Mol Cell Biol 21(10):3281-3288.
^ Gooding C, Roberts GC, Smith CW. (1998). Rola hamującego elementu pirymidynowego i białka wiążącego przewód polipirymidynowy w represji regulowanego egzonu alfa-tropomiozyny. RNA 4:85-100.
^ Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). Specyficzne dla mięśni gładkich przełączanie wzajemnie wykluczającego się wyboru eksonu alfa-tropomiozyny poprzez specyficzne hamowanie silnego egzonu domyślnego. EMBO J 13(16):3861-72.

[Lodish-1] Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser CA, Krieger M, Scott MP, Zipursky SL, Darnell J. (2004). Biologia molekularna komórki. WH Freeman: Nowy Jork, NY. 5. wyd.

[Wagner-2] Wagner EJ, Garcia-Blanco MA. (2001). Białko wiążące przewód polipirymidynowy antagonizuje definicję eksonu. Mol Cell Biol 21(10):3281-3288.

[Gooding-3] Gooding C, Roberts GC, Smith CW. (1998). Rola hamującego elementu pirymidynowego i białka wiążącego przewód polipirymidynowy w represji regulowanego egzonu alfa-tropomiozyny. RNA 4:85-100.

[Gooding2-4] Gooding C, Roberts GC, Moreau G, Nadal-Ginard B, Smith CW. (1994). Specyficzne dla mięśni gładkich przełączanie wzajemnie wykluczającego się wyboru eksonu alfa-tropomiozyny poprzez specyficzne hamowanie silnego egzonu domyślnego. EMBO J 13(16):3861-72.