WYDRUKI

W biologii molekularnej baza danych PRINTS jest zbiorem tak zwanych „odcisków palców”: zapewnia zarówno szczegółowe źródło adnotacji dla rodzin białek , jak i narzędzie diagnostyczne dla nowo określonych sekwencji. Odcisk palca to grupa konserwatywnych motywów zaczerpniętych z dopasowania wielu sekwencji - razem motywy tworzą charakterystyczną sygnaturę dla wyrównanej rodziny białek. Same motywy niekoniecznie są ciągłe w sekwencji, ale mogą łączyć się w przestrzeni 3D, aby zdefiniować molekularne miejsca wiązania lub powierzchnie interakcji. Szczególna siła diagnostyczna odcisków palców polega na ich zdolności do rozróżniania różnic sekwencji na poziomie klanu, nadrodziny, rodziny i podrodziny. Pozwala to na szczegółową diagnostykę funkcjonalną niescharakteryzowanych sekwencji, umożliwiając na przykład rozróżnienie między członkami rodziny na podstawie ligandów, z którymi się wiążą lub białek, z którymi oddziałują, oraz podkreślając potencjalne miejsca oligomeryzacji lub allosteryczne.

PRINTS jest partnerem-założycielem zintegrowanego zasobu InterPro , szeroko stosowanej bazy danych rodzin białek, domen i miejsc funkcjonalnych.

Linki zewnętrzne

• Baza danych PRINTS (University of Manchester Bioinformatics Education and Research)