Wirus kolisty związany z kałem bydlęcym

Wirus kolisty związany z kałem bydlęcym
Klasyfikacja wirusów
Grupa:	Grupa II ( ssDNA )

Wirus kolisty związany z kałem bydlęcym to jednoniciowy wirus DNA z kolistym genomem, który został wyizolowany z kału bydlęcego. Został również wyizolowany ze stolca świni. Dlatego synonimem wydaje się wirus cyrkularny związany ze stolcem świńskim , proponowany gatunek, który nie został jeszcze zaakceptowany przez ICTV .

Wirusologia

Wirus ten został wyizolowany z krów i świń, które wydawały się zdrowe.

Genom

Genom to jednoniciowa kolista cząsteczka DNA o długości 2600 zasad. Ma dwie otwarte ramki odczytu kodujące replikazę i białko kapsydu . Ramki odczytu są rozmieszczone w genomie w przeciwnych kierunkach. Pomiędzy końcami 3' otwartych ramek odczytu znajduje się pętla łodygi. To jest jak kolisty wirus związany z kałem szympansa iw przeciwieństwie do jakiegokolwiek innego znanego kolistego wirusa DNA.

Taksonomia

Wydaje się, że wirus ten tworzy klad z wirusem kolistym związanym z odchodami szympansów . Ich związek z innymi wirusami nie jest jeszcze znany. Wydaje się, że najbliższymi krewnymi są Nanoviridae , ale wyjaśnienie tej kwestii wymaga dalszych prac.

Jednak wydaje się, że wirus kołowy związany z kałem świńskim jest niesklasyfikowanym członkiem akceptowanego przez ICTV rodzaju Porprismacovirus z rodziny Smacoviridae , tak samo jak wirus kołowy związany z kałem szympansa . Nanoviridae i Smacoviridae są członkami klasy Arfiviricetes .