Wirus winorośli Pinot gris
| Wirus winorośli Pinot gris | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Kitrinoviricota |
| Klasa: | Alsuviricetes |
| Zamówienie: | Tymovirale |
| Rodzina: | Betaflexiviridae |
| Rodzaj: | Trichowirus |
| Gatunek: |
Wirus winorośli Pinot gris
|
Wirus winorośli Pinot gris (GPGV) jest jednoniciowym wirusem RNA z rodzaju Trichovirus . Wpływa na wzrost winorośli i jest podobny do wirusa wewnętrznej martwicy jagód winorośli.
Historia
.svg)
Winnice w północno-zachodnich Włoszech zaczęły zauważać objawy GPGV w 2003 roku. Pierwsze dwie dotknięte winnice to Piana Rotaliana i Collio w Trentino Alto Adige. Stamtąd wirus rozprzestrzenił się na winnice w Trentino Alto Adige i Friuli-Wenecji Julijskiej, a następnie w Emilii-Romanii i Wenecji Euganejskiej. Wirus został po raz pierwszy zidentyfikowany na winorośli Pinot gris, stąd nazwa, ale wkrótce rozprzestrzenił się na inne odmiany. W 2011 roku Annalisa Giampetruzzi i in. opublikował artykuł w czasopiśmie Virus Research oficjalnie identyfikując i nazywając wirusa. Giampetruzzi i jej współpracownicy wykorzystali głębokie sekwencjonowanie, aby znaleźć podobieństwa do innych wirusów i znaleźli odcinki wirusowego genomu RNA, które odpowiadały sekwencjom znalezionym w genomach RNA zarówno wirusa martwicy wewnętrznej jagód winorośli (GINV), jak i wirusa związanego z wżerami pnia winorośli (GRSPaV). ). Stwierdzono również mniejsze odsetki innych genomów wirusowych. Ponieważ jego pełnej sekwencji genomowej nie można było znaleźć w bazie danych sekwencji referencyjnych NCBI , genom uznano za całkowicie nowy, a wirusa oficjalnie nazwano wirusem Grapevine Pinot gris. Wirus został rozpoznany przez Narodową Agencję Ochrony Roślin we Włoszech w lutym 2014 r., a ProMEDMail opublikował pierwszą relację o jego istnieniu. Po przybyciu do różnych regionów Włoch wirus rozprzestrzeniał się w całej Europie, w grudniu 2014 r. wykryto go w Czechach i na Słowacji. W listopadzie 2015 r. wirus został wykryty w Kalifornii, aw kwietniu 2016 r. w chińskich winnicach w prowincjach Liaoning, Pekin i Zhejiang. Ostatnie ognisko wirusa miało miejsce w Australii w sierpniu 2017 r.
Klasyfikacja
GPGV jest dodatnim wirusem jednoniciowego RNA, co oznacza, że genom wirusa składa się z nukleotydów RNA . Podczas gdy Giampetruzzi i jej współpracownicy stwierdzili, że genom ma podobieństwa do marafiwirusów Grapevine Syrah virus-1 i Grapevine Rupestris vegeting virus, okazało się, że jest on bardziej podobny do rodzaju Trichovirus . Oprócz GINV, inne trichowirusy obejmują wirusa chlorotycznej plamistości liści jabłoni , wirusa pseudochlorotycznej plamistości liści moreli, wirusa pstrości liści wiśni i wirusa mozaiki brzoskwini.
Struktura genomu
Giampetruzzi i in. pierwotnie zgłosili kompletną sekwencję konsensusową 7258 nukleotydów (z wyłączeniem ogona poliA), która tworzy trzy nakładające się ramki odczytu (ORF). Długość każdej ORF w parach zasad, waga w kilodaltonach oraz białka/ enzymy , dla których koduje, znajdują się w poniższej tabeli. Sekwencja następnie przebiega z nieulegającym translacji regionem o długości 82 par zasad i kończy się ogonem poliA, który jest typowy dla genomów wirusowych.
| Długość | Waga | Enzymy | Notatki | |
|---|---|---|---|---|
| ORF1 | 1865 | 214 kDa | Białka związane z replikazą, metylotransferaza, helikaza i RdRp | Zawiera również domenę AlkB i kody dla motywów i reszt koordynacyjnych Fe 2+ |
| ORF2 | 376 | 42 kDa | Białka ruchowe homologiczne do tych występujących w wirusie chlorotycznej plamistości liści jabłoni | |
| ORF3 | 195 | 22 kDa | Domniemane białko płaszcza |
Objawy
Objawy są najbardziej widoczne na wiosnę, kiedy zaczynają rosnąć nowe pędy i liście. Objawy GPGV obejmują chlorotyczne plamistość liści, deformację liści, zahamowanie wzrostu, owoce niskiej jakości, nieprawidłowe rozgałęzienia i zmniejszoną wydajność. Najczęstszymi objawami są plamistość i deformacja liści. Inne odnotowane objawy to opóźnienie pękania pąków, skrócenie międzywęźli i bardziej kwaśne jagody. Należy również zauważyć, że objawy mogą nawet nie być widoczne na zainfekowanych roślinach.
Cykl replikacji
Cykl replikacji tego wirusa nie jest obecnie znany. Możliwe rezerwuary mogą obejmować owady, roztocza lub nicienie . Opierając się na nowszym odkryciu wirusa, nie przeprowadzono zbyt wielu badań w tym aspekcie.
Rozprzestrzenianie się wirusa
Powszechnie przyjmuje się, że wirus ten jest przenoszony przez zainfekowane maszyny, materiały i narzędzia do rozmnażania oraz prawdopodobnie przez handel rozmnażanymi łodygami między winnicami.