Wyzwanie Ebbe Nielsena

Ebbe Nielsen Challenge to międzynarodowy konkurs naukowy organizowany corocznie od 2015 r. przez Global Biodiversity Information Facility (GBIF), z zestawem nagród pieniężnych, które są wyrazem uznania dla prac naukowca (-ów) w tworzeniu oprogramowania lub podejść, które z powodzeniem rozwiązują problem wydany przez GBIF wyzwanie w dziedzinie informatyki bioróżnorodności . Jest następcą nagrody Ebbe Nielsena , przyznawanej corocznie przez GBIF w latach 2002-2014. Nazwa wyzwania jest uhonorowaniem pamięci wybitnego entomologa i orędownika informatyki bioróżnorodności Ebbe Nielsena , który zmarł na zawał serca w USA w drodze do 2001 roku Spotkanie Rady Zarządzającej GBIF.

Historia

W 2001 roku GBIF stworzył nagrodę Ebbe Nielsena , aby uhonorować niedawno zmarłego duńsko-australijskiego entomologa Ebbe Nielsena , który był gorącym orędownikiem zarówno GBIF, jak i dyscypliny informatyki bioróżnorodności. Nagroda ta była wyrazem uznania dla globalnego naukowca lub zespołu badawczego za ich retrospektywny wkład w dziedzinę informatyki różnorodności biologicznej , zgodnie z kryteriami określonymi przez GBIF w warunkach przyznania nagrody. Od 2015 r. GBIF ponownie uruchomił proces przyznawania nagród jako konkurs między osobami lub zespołami naukowców z całego świata w celu stworzenia nowego oprogramowania lub podejścia do wykorzystania danych o różnorodności biologicznej zgodnie z tematem ogłaszanym corocznie w każdej rundzie konkursu, a także do podziału nagrody pieniądze wśród wielu grup zamiast jednego zwycięzcy, jak w początkowej erze Nagrody. Zaproszenia do zgłoszeń do konkursu, zwanego obecnie „Ebbe Nielsen Challenge”, są wydawane corocznie od 2015 r.

Lista zwycięzców, począwszy od 2015 r

2015

Wyzwanie: „Wykorzystaj w znaczący sposób dane za pośrednictwem GBIF w sposób, który dostarczy nowych reprezentacji lub spostrzeżeń. Twoje zgłoszenie może obejmować szereg wyników — strony internetowe, samodzielne lub mobilne aplikacje lub wyniki analiz — lub może dążyć do ulepszenia dowolnych liczbę problemów lub procesów, w tym (między innymi) analizę lub wizualizację danych, przepływy danych, przesyłanie lub adnotacje”.

Lista finalistów Challenge 2015 jest dostępna tutaj.

Zdobywca pierwszej nagrody:

  • GBIF Dataset Metrics ” — Peter Desmet, Bart Aelterman i Nicolas Noé (Belgia)

Laureat II nagrody:

Szczegóły są dostępne na stronie GBIF tutaj.

2016

Wyzwanie: „W 2016 r. Wyzwanie będzie koncentrować się na kwestii luk w danych i ich kompletności, poszukując narzędzi, metod i mechanizmów, które pomogą w analizie przydatności do wykorzystania danych, w których pośredniczy GBIF i/lub wytyczają priorytety w zakresie mobilizacji danych o różnorodności biologicznej. Oczekujemy, że zarówno użytkownicy danych, jak i posiadacze danych odniosą korzyści z tegorocznego nacisku na luki i kompletność”.

Laureat pierwszej nagrody:

  • Odkrywanie ignorancji w czasie i przestrzeni ” – Alejandro Ruete (Argentyna)

Łączni zdobywcy II nagrody:

  • " sampbias " - Alexander Zizka, Alexandre Antonelli i Daniele Silvestro (Szwecja)
  • GBIF Coverage Assessment Tools ” — Walter Jetz, Jeremy Malczyk, Carsten Meyer, Michelle Duong, Ajay Ranipeta i Luis J. Villanueva (Stany Zjednoczone, RPA i Niemcy)

Szczegóły są dostępne na stronie GBIF tutaj.

2017

Wyzwanie: „Wyzwanie GBIF Ebbe Nielsen Challenge 2017 dotyczy zgłoszeń, które zmienią przeznaczenie tych zbiorów danych [w ogólnodostępnych repozytoriach publicznych] i dostosują je do formatu Darwin Core Archive (DwC-A), interoperacyjnego standardu wielokrotnego użytku, który umożliwia publikację prawie 800 milionów rekordów występowania gatunków z prawie 1000 światowych instytucji działających obecnie w sieci GBIF.Ebbe Nielsen Challenge 2017 zleci programistom i analitykom danych tworzenie aplikacji internetowych, skryptów lub innych narzędzi, które automatyzują odkrywanie i wydobywanie odpowiednich danych o różnorodności biologicznej z otwartych danych repozytoria”.

Nie ogłoszono żadnych zwycięzców, co wskazuje, że nagroda pieniężna 2017 nie została przyznana żadnemu wpisowi.

2018

Wyzwanie: „Wyzwanie Ebbe Nielsena 2018 jest celowo otwarte, więc uczestnicy mają szerokie kompetencje w zakresie tworzenia narzędzi i technik, które rozwijają otwartą naukę i poprawiają dostęp, użyteczność lub jakość danych, w których pośredniczy GBIF. Zgłoszenia do wyzwania mogą dotyczyć nowych aplikacji , metody wizualizacji, przepływy pracy lub analizy, lub też opierają się na istniejących narzędziach i funkcjach i je rozszerzają”.

Łączni laureaci pierwszej nagrody:

  • Przepis na listę kontrolną: szablon do powtarzalnej standaryzacji danych z listy kontrolnej gatunków ” – Lien Reyserhove, Damiano Oldoni i Peter Desmet (Belgia)
  • Ozymandias: wykres wiedzy o różnorodności biologicznej ” – Roderic DM Page (Wielka Brytania)

Łączni zdobywcy II nagrody:

  • " The bdverse " - Tomer Gueta, Yohay Carmel, Vijay Barve, Thiloshon Nagarajah, Povilas Gibas, Ashwin Agrawal (Izrael, Stany Zjednoczone, Sri Lanka, Litwa i Indie)
  • Eksplorator problemów GBIF ” — Luis J. Villanueva (Stany Zjednoczone)
  • Inteligentna pułapka na komary w rurociągu DwC ” — Connor Howington i Samuel Rund (Stany Zjednoczone)
  • Edytor drzewa taksonomii ” – Ashish Singh Tomar (Hiszpania)

Szczegóły są dostępne na stronie GBIF tutaj.

2019

Wyzwanie: „Wyzwanie Ebbe Nielsena 2019 jest celowo otwarte, więc uczestnicy mają szerokie kompetencje w zakresie tworzenia narzędzi i technik, które rozwijają otwartą naukę i poprawiają dostęp, użyteczność lub jakość danych, w których pośredniczy GBIF. Zgłoszenia do wyzwania mogą dotyczyć nowych aplikacji , metody wizualizacji, przepływy pracy lub analizy, lub opierają się na istniejących narzędziach i funkcjach i rozszerzają je. Oczekuje się, że udane zgłoszenia zapewnią praktyczne, pragmatyczne rozwiązania dla sieci GBIF, jednocześnie rozwijając informatykę dotyczącą różnorodności biologicznej i zarządzanie danymi dotyczącymi różnorodności biologicznej w odniesieniu do misji GBIF i strategicznych plan."

Laureat pierwszej nagrody:

  • WhereNext: system rekomendacji do określania priorytetów pobierania próbek w oparciu o modelowanie uogólnionej odmienności ” – Jorge Velásquez-Tibatá (Kolumbia)

Łączni zdobywcy II nagrody:

  • occCite: Tools to Enable Comprehensive Biodiversity Data Citation ” — Hannah L. Owens, Cory Merow, Brian S. Maitner, Vijay V. Barve i Robert Guralnick (Dania, Stany Zjednoczone)
  • " Organella " - Andrea Biedermann, Diana Gert, Dimitar Ruszew i Paul Roeder (Niemcy)
  • Szybka najmniejsza troska: zautomatyzowana ocena roślin niższego ryzyka dla Czerwonej Księgi Gatunków Zagrożonych IUCN (Czerwona lista) ” — Steven Bachman, Barnaby Walker i Justin Moat (Wielka Brytania)

Łączni laureaci trzeciej nagrody:

  • Agile GBIF Publishing ” – Evgeniy Meyke (Finlandia)
  • Przegląd informacji o różnorodności biologicznej i wsparcie decyzji: pakiet BIRDS dla R ” — Debora Arlt, Alejandro Ruete i Anton Hammarström (Szwecja)
  • Przesiewacz GB: przesiewacz danych z GBIF do GenBanku ” — Luis Allende (Stany Zjednoczone)
  • " naturaList " - Arthur Vinicius Rodrigues & Gabriel Nakamura (Brazylia)
  • GeoNature-atlas: Opublikuj internetowy atlas różnorodności biologicznej z danymi GBIF z Twojego obszaru ” — Jordan Sellies, Amandine Sahl (Francja)

Szczegóły są dostępne na stronie GBIF tutaj.