domena CVNH

CVNH
PDB 1iiy EBI.jpg
nmr struktura kompleksu 1:2 cyjanowiryna-n:man-alfa 1,2-man-alfa ograniczona regularna średnia współrzędnych
Identyfikatory
Symbol CVNH
Pfam PF08881
InterPro IPR011058
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury

W biologii molekularnej domena CVNH ( domena CyanoVirin - NHomology ) jest konserwatywną domeną białkową . Występuje w wiążącym cukier przeciwwirusowym białku cyjanowirynie-N (CVN), a także w białkach workowców nitkowatych i paproci Ceratopteris richardii .

Cyjanowiryna-N (CV-N) to białko o masie 11 kDa z cyjanobakterii Nostoc ellipsosporum , które wykazuje aktywność wirusobójczą przeciwko kilku wirusom, w tym ludzkiemu wirusowi niedoboru odporności (AIDS). W wirusobójczym działaniu CV-N pośredniczą specyficzne interakcje o wysokim powinowactwie z glikoproteinami otoczki wirusowej gp120 i gp41 , jak również z oligosacharydami o dużej zawartości mannozy znajdującymi się w otoczce wirusa HIV. Ponadto CV-N jest aktywny przeciwko rinowirusom, ludzkiemu wirusowi parainfluenzy, syncytialnemu wirusowi oddechowemu i wirusom jelitowym. Działanie wirusobójcze CV-N przeciwko wirusowi grypy jest skierowane na hemaglutyninę wirusową. CV-N ma złożoną fałdę złożoną z duplikacji tandemowego powtórzenia dwóch homologicznych motywów zawierających trójniciowy arkusz beta i spinki do włosów beta .

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR011058