Amfipatyczne motywy czujnika upakowania lipidów

amfipatycznego czujnika pakowania lipidów (ALPS) zostały po raz pierwszy zidentyfikowane w 2005 roku w ARFGAP1 i zostały poddane przeglądowi.

Amfipatyczne upakowanie lipidów Motywy sensoryczne białek wiążą się ( adsorbują ) z zakrzywionymi dwuwarstwami lipidowymi.

Zakrzywienie dwuwarstwy fosfolipidowej , na przykład w liposom , powoduje zaburzenia upakowania lipidów po stronie dwuwarstwy, która ma większą powierzchnię (na przykład na zewnątrz liposomu). Mniej „uporządkowane” lub „luźniejsze” upakowanie lipidów jest rozpoznawane przez motywy ALPS.

Motywy ALPS to fragmenty białek o długości od 20 do 40 aminokwasów , które mają ważne kolekcje typów reszt aminokwasowych. Masywne hydrofobowe reszty aminokwasowe, takie jak fenyloalanina , leucyna i tryptofan , są obecne co 3 lub 4 pozycje, z wieloma polarnymi , ale nienaładowanymi resztami aminokwasowymi, takimi jak glicyna , seryna i treonina pomiędzy. ALPS nie ma struktury w roztworze, ale fałduje się jako helisa alfa , gdy jest związany z dwuwarstwą błony, tak że reszty hydrofobowe wstawiają się między luźno upakowane lipidy, a reszty polarne są skierowane w stronę wodnej cytoplazmy .