Baza wektorów
VectorBase jest jednym z pięciu Centrów Zasobów Bioinformatycznych (BRC) finansowanych przez National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), składnik National Institutes of Health (NIH), który jest agencją Departamentu Zdrowia i Usługi ludzkie . VectorBase koncentruje się na wektorach bezkręgowców ludzkich patogenów , współpracując z ośrodkami sekwencjonowania i społecznością badawczą w celu selekcji genomów wektorowych (głównie adnotacji genomu ).
Genomy uwzględnione w bazie danych VectorBase
- Aedes aegypti
- Anopheles gambiae
- Culex quinquefasciatus
- Ixodes scapularis
- Pediculus humanus
- Rhodnius prolixus
Narzędzia dostępne w witrynie VectorBase
- Przeglądarka genomu
- System adnotacji społeczności
- Repozytorium mikromacierzy i ekspresji genów
- Kontrolowane słownictwo dotyczące anatomii, odporności na środki owadobójcze i chorób przenoszonych przez wektory (malaria i gorączka denga)
- BLAST wyszukuje wszystkie objęte genomy
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- wektorbase.org
- Centra zasobów bioinformatycznych Strona NIAID opisująca cele i działania BRC
- Pathogen Portal Hub dla pięciu BRC; zawiera informacje podsumowujące
- Przeglądarki genomu VectorBase
- Przeglądarka genomu Aedes aegypti w VectorBase
- Przeglądarka genomu Anopheles gambiae w VectorBase
- Przeglądarka genomu Culex quinquefasciatus w VectorBase
- Przeglądarka genomu Ixodes scapularis w VectorBase
- Przeglądarka genomu Pediculus humanus w VectorBase
- Przeglądarka genomu Rhodnius prolixus w VectorBase
