Białko transbłonowe 175
| Białko transbłonowe 175 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | TMEM175 | ||||||||
| Pfam | PF06736 | ||||||||
| InterPro | IPR010617 | ||||||||
| TCDB | 1.A.78 | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 467 | ||||||||
| Białko OPM | 5vre | ||||||||
| |||||||||
| Białko transbłonowe 175 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||
| Symbol | TMEM175 | ||||||
| Alt. symbolika | MGC4618 | ||||||
| gen NCBI | 84286 | ||||||
| HGNC | 28709 | ||||||
| RefSeq | NM_032326 | ||||||
| UniProt | Q9BSA9 | ||||||
| Inne dane | |||||||
| Umiejscowienie | Chr. 4 s. 16.3 | ||||||
| |||||||
Białko transbłonowe 175 lub TMEM175 jest białkiem transbłonowym , które uważa się za endolizosomalny kanał potasowy. Przewiduje się, że ma wiele ortologów u eukariontów .
Wyrażenie
Na podstawie profili ludzkich i mysich EST oraz profilu GEO tkanek ludzkich, wydaje się, że TMEM175 ulega ekspresji na stosunkowo wysokim poziomie (75-98%) w normalnych tkankach. Wydaje się, że TMEM175 jest obniżony w trzecim stadium raka jajnika
Homologia
Białko transbłonowe 175 nie ma paralogów. Ma ortologów w eukariontach. W poniższej tabeli przedstawiono niektóre ortologi znalezione przy użyciu wyszukiwań w BLAST i BLAT . Ta lista nie zawiera wszystkich ortologów dla TMEM175. Ma to na celu pokazanie różnorodności gatunków, dla których znaleziono ortologi.
| Nazwa naukowa | Nazwa zwyczajowa | Numer dostępowy | Długość sekwencji | Procent tożsamości | Procent podobieństwa |
|---|---|---|---|---|---|
| homo sapiens | Człowiek | NP_115702.1 | 504 | - | - |
| Panowie troglodyci | Szympans | XP_001141076 | 504 | 92 | 93 |
| Pongo abelii | Orangutan | XP_002814537 | 231 | 99 | 99 |
| Macaca Mulat | Rezus | XP_001085173.1 | 403 | 96 | 98 |
| Callithrix jacchus | Pazurczatka | XP_002746113.1 | 472 | 83 | 87 |
| Bos byk | Krowa | NP_001069081.1 | 479 | 77 | 82 |
| Ailuropoda melanoleuca | Panda | XP_002924455.1 | 498 | 81 | 87 |
| Equus caballus | Koń | XP_001488271.1 | 499 | 81 | 86 |
| Rattus norvegicus | Szczur | NP_001014013.1 | 499 | 82 | 88 |
| Mus musculus | Mysz | NP_082499.3 | 499 | 81 | 88 |
| Monodelphis domestica | Opos | XP_001377424.1 | 502 | 67 | 80 |
| Ornithorhynchus anatinus | Dziobak | XP_001514176 | 499 | 68 | 82 |
| Gallus gallus | Kurczak | NP_001006582.1 | 501 | 64 | 78 |
| Sceloporus occidentalis | Jaszczurka | - | 417 | 56 | 66 |
| Taeniopygia guttata | Zięba zebry | XP_002187908.1 | 496 | 66 | 79 |
| Danio Rerio | Ryba zebry | NP_001093545.1 | 520 | 62 | 76 |
| Branchiostoma floridae | Lancet | XP_002596272 | 409 | 31 | 50 |
| Ciona jelitowa | Tryskacz morski | XP_002122718 | 494 | 27 | 50 |
| Nematostella vectensis | Zawilec morski Starlet | XP_001630719 | 489 | 28 | 49 |
Przewidywana modyfikacja potranslacyjna
Przy użyciu różnych narzędzi w ExPASy możliwe są następujące modyfikacje potranslacyjne dla TMEM175.
- 5 możliwych miejsc fosforylacji CK2
- 2 możliwe miejsca fosforylacji PKC
- Miejsca N-mirystoilacji wokół regionów transbłonowych
Miejsca N-mirystoilacji są zachowane u kręgowców .